Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA3AQ14563 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA3AQ14563 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA3AQ14563 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA3AQ14563 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA3AQ14563 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA3AQ14563 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA3AQ14563 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA3AQ14563 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA3AQ14563 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA3AQ14563 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA3AQ14563 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA3AQ14563 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA3AQ14563 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA3AQ14563 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA3AQ14563 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA3AQ14563 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA3AQ14563 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA3AQ14563 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA3AQ14563 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA3AQ14563 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA3AQ14563 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA3AQ14563 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA3AQ14563 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA3AQ14563 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA3AQ14563 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA3AQ14563 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA3AQ14563 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA3AQ14563 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA3AQ14563 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA3AQ14563 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA3AQ14563 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA3AQ14563 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA3AQ14563 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA3AQ14563 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA3AQ14563 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA3AQ14563 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA3AQ14563 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA3AQ14563 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA3AQ14563 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA3AQ14563 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA3AQ14563 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA3AQ14563 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA3AQ14563 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA3AQ14563 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA3AQ14563 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA3AQ14563 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA3AQ14563 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA3AQ14563 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA3AQ14563 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA3AQ14563 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA3AQ14563 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA3AQ14563 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA3AQ14563 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA3AQ14563 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA3AQ14563 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA3AQ14563 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA3AQ14563 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA3AQ14563 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA3AQ14563 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA3AQ14563 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3AQ14563 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3AQ14563 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3AQ14563 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3AQ14563 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA3AQ14563 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA3AQ14563 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA3AQ14563 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA3AQ14563 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA3AQ14563 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA3AQ14563 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SEMA3AQ14563 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3AQ14563 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3AQ14563 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3AQ14563 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3AQ14563 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3AQ14563 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3AQ14563 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3AQ14563 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3AQ14563 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA3AQ14563 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA3AQ14563 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA3AQ14563 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA3AQ14563 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA3AQ14563 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA3AQ14563 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA3AQ14563 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA3AQ14563 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA3AQ14563 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA3AQ14563 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SEMA3AQ14563 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEMA3AQ14563 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEMA3AQ14563 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA3AQ14563 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA3AQ14563 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA3AQ14563 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA3AQ14563 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SEMA3AQ14563 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA3AQ14563 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA3AQ14563 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
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