Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PKP1Q13835 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PKP1Q13835 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PKP1Q13835 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PKP1Q13835 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PKP1Q13835 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PKP1Q13835 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PKP1Q13835 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PKP1Q13835 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PKP1Q13835 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PKP1Q13835 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PKP1Q13835 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PKP1Q13835 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
PKP1Q13835 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PKP1Q13835 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PKP1Q13835 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PKP1Q13835 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PKP1Q13835 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PKP1Q13835 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PKP1Q13835 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PKP1Q13835 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PKP1Q13835 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PKP1Q13835 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PKP1Q13835 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PKP1Q13835 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PKP1Q13835 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PKP1Q13835 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PKP1Q13835 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PKP1Q13835 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PKP1Q13835 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PKP1Q13835 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PKP1Q13835 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PKP1Q13835 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PKP1Q13835 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PKP1Q13835 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PKP1Q13835 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PKP1Q13835 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PKP1Q13835 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PKP1Q13835 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PKP1Q13835 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PKP1Q13835 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PKP1Q13835 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PKP1Q13835 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PKP1Q13835 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PKP1Q13835 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PKP1Q13835 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PKP1Q13835 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PKP1Q13835 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PKP1Q13835 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PKP1Q13835 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PKP1Q13835 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PKP1Q13835 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PKP1Q13835 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PKP1Q13835 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PKP1Q13835 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PKP1Q13835 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PKP1Q13835 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PKP1Q13835 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PKP1Q13835 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PKP1Q13835 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PKP1Q13835 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PKP1Q13835 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
PKP1Q13835 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PKP1Q13835 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PKP1Q13835 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PKP1Q13835 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PKP1Q13835 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PKP1Q13835 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PKP1Q13835 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PKP1Q13835 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PKP1Q13835 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PKP1Q13835 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PKP1Q13835 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PKP1Q13835 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PKP1Q13835 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PKP1Q13835 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PKP1Q13835 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PKP1Q13835 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PKP1Q13835 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PKP1Q13835 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PKP1Q13835 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PKP1Q13835 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PKP1Q13835 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PKP1Q13835 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PKP1Q13835 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PKP1Q13835 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PKP1Q13835 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PKP1Q13835 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PKP1Q13835 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PKP1Q13835 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PKP1Q13835 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PKP1Q13835 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PKP1Q13835 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PKP1Q13835 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PKP1Q13835 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PKP1Q13835 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PKP1Q13835 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PKP1Q13835 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PKP1Q13835 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PKP1Q13835 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
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