Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTAN1Q13813 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTAN1Q13813 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTAN1Q13813 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTAN1Q13813 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTAN1Q13813 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTAN1Q13813 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTAN1Q13813 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTAN1Q13813 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTAN1Q13813 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTAN1Q13813 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTAN1Q13813 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTAN1Q13813 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTAN1Q13813 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTAN1Q13813 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTAN1Q13813 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTAN1Q13813 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTAN1Q13813 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTAN1Q13813 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTAN1Q13813 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTAN1Q13813 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTAN1Q13813 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPTAN1Q13813 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPTAN1Q13813 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTAN1Q13813 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTAN1Q13813 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTAN1Q13813 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTAN1Q13813 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPTAN1Q13813 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPTAN1Q13813 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPTAN1Q13813 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTAN1Q13813 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTAN1Q13813 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTAN1Q13813 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTAN1Q13813 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTAN1Q13813 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTAN1Q13813 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTAN1Q13813 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTAN1Q13813 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTAN1Q13813 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTAN1Q13813 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPTAN1Q13813 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SPTAN1Q13813 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTAN1Q13813 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTAN1Q13813 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTAN1Q13813 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTAN1Q13813 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTAN1Q13813 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTAN1Q13813 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTAN1Q13813 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTAN1Q13813 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTAN1Q13813 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTAN1Q13813 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTAN1Q13813 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTAN1Q13813 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTAN1Q13813 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTAN1Q13813 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTAN1Q13813 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTAN1Q13813 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTAN1Q13813 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTAN1Q13813 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTAN1Q13813 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTAN1Q13813 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTAN1Q13813 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTAN1Q13813 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTAN1Q13813 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTAN1Q13813 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTAN1Q13813 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTAN1Q13813 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTAN1Q13813 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTAN1Q13813 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTAN1Q13813 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTAN1Q13813 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTAN1Q13813 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTAN1Q13813 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTAN1Q13813 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTAN1Q13813 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTAN1Q13813 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTAN1Q13813 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTAN1Q13813 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTAN1Q13813 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTAN1Q13813 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTAN1Q13813 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTAN1Q13813 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTAN1Q13813 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTAN1Q13813 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
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