Protein–RNA interactions for Protein: Q13363

CTBP1, C-terminal-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1Q13363 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTBP1Q13363 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTBP1Q13363 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTBP1Q13363 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CTBP1Q13363 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CTBP1Q13363 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTBP1Q13363 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTBP1Q13363 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTBP1Q13363 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTBP1Q13363 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTBP1Q13363 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTBP1Q13363 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTBP1Q13363 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTBP1Q13363 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTBP1Q13363 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTBP1Q13363 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTBP1Q13363 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTBP1Q13363 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTBP1Q13363 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTBP1Q13363 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTBP1Q13363 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTBP1Q13363 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CTBP1Q13363 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTBP1Q13363 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTBP1Q13363 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTBP1Q13363 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTBP1Q13363 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTBP1Q13363 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTBP1Q13363 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTBP1Q13363 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTBP1Q13363 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTBP1Q13363 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTBP1Q13363 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTBP1Q13363 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTBP1Q13363 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTBP1Q13363 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTBP1Q13363 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTBP1Q13363 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTBP1Q13363 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTBP1Q13363 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTBP1Q13363 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTBP1Q13363 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTBP1Q13363 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTBP1Q13363 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTBP1Q13363 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTBP1Q13363 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTBP1Q13363 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTBP1Q13363 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTBP1Q13363 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTBP1Q13363 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTBP1Q13363 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTBP1Q13363 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTBP1Q13363 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTBP1Q13363 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTBP1Q13363 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CTBP1Q13363 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTBP1Q13363 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTBP1Q13363 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTBP1Q13363 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTBP1Q13363 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTBP1Q13363 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTBP1Q13363 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTBP1Q13363 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CTBP1Q13363 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTBP1Q13363 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTBP1Q13363 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTBP1Q13363 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTBP1Q13363 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTBP1Q13363 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTBP1Q13363 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTBP1Q13363 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTBP1Q13363 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTBP1Q13363 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTBP1Q13363 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTBP1Q13363 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTBP1Q13363 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTBP1Q13363 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTBP1Q13363 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTBP1Q13363 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTBP1Q13363 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTBP1Q13363 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTBP1Q13363 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTBP1Q13363 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTBP1Q13363 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CTBP1Q13363 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTBP1Q13363 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTBP1Q13363 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTBP1Q13363 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CTBP1Q13363 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTBP1Q13363 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTBP1Q13363 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTBP1Q13363 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTBP1Q13363 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTBP1Q13363 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTBP1Q13363 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTBP1Q13363 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTBP1Q13363 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTBP1Q13363 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTBP1Q13363 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTBP1Q13363 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms