Protein–RNA interactions for Protein: Q13233

MAP3K1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K1Q13233 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
MAP3K1Q13233 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
MAP3K1Q13233 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.96
MAP3K1Q13233 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
MAP3K1Q13233 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
MAP3K1Q13233 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
MAP3K1Q13233 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
MAP3K1Q13233 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
MAP3K1Q13233 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
MAP3K1Q13233 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
MAP3K1Q13233 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
MAP3K1Q13233 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC39.77■■■■□ 3.96
MAP3K1Q13233 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC39.77■■■■□ 3.96
MAP3K1Q13233 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC39.76■■■■□ 3.96
MAP3K1Q13233 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.95
MAP3K1Q13233 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
MAP3K1Q13233 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
MAP3K1Q13233 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.75■■■■□ 3.95
MAP3K1Q13233 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
MAP3K1Q13233 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
MAP3K1Q13233 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
MAP3K1Q13233 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
MAP3K1Q13233 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
MAP3K1Q13233 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
MAP3K1Q13233 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
MAP3K1Q13233 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
MAP3K1Q13233 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC39.69■■■■□ 3.94
MAP3K1Q13233 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
MAP3K1Q13233 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
MAP3K1Q13233 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
MAP3K1Q13233 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC39.66■■■■□ 3.94
MAP3K1Q13233 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
MAP3K1Q13233 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
MAP3K1Q13233 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
MAP3K1Q13233 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC39.63■■■■□ 3.93
MAP3K1Q13233 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
MAP3K1Q13233 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC39.62■■■■□ 3.93
MAP3K1Q13233 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
MAP3K1Q13233 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
MAP3K1Q13233 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC39.61■■■■□ 3.93
MAP3K1Q13233 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
MAP3K1Q13233 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
MAP3K1Q13233 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
MAP3K1Q13233 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
MAP3K1Q13233 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
MAP3K1Q13233 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
MAP3K1Q13233 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
MAP3K1Q13233 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
MAP3K1Q13233 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
MAP3K1Q13233 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
MAP3K1Q13233 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC39.58■■■■□ 3.93
MAP3K1Q13233 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
MAP3K1Q13233 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC39.58■■■■□ 3.93
MAP3K1Q13233 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
MAP3K1Q13233 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
MAP3K1Q13233 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
MAP3K1Q13233 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC39.57■■■■□ 3.92
MAP3K1Q13233 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
MAP3K1Q13233 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC39.56■■■■□ 3.92
MAP3K1Q13233 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
MAP3K1Q13233 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
MAP3K1Q13233 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
MAP3K1Q13233 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
MAP3K1Q13233 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
MAP3K1Q13233 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
MAP3K1Q13233 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
MAP3K1Q13233 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
MAP3K1Q13233 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
MAP3K1Q13233 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
MAP3K1Q13233 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
MAP3K1Q13233 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
MAP3K1Q13233 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
MAP3K1Q13233 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
MAP3K1Q13233 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
MAP3K1Q13233 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC39.5■■■■□ 3.91
MAP3K1Q13233 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
MAP3K1Q13233 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
MAP3K1Q13233 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
MAP3K1Q13233 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
MAP3K1Q13233 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
MAP3K1Q13233 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
MAP3K1Q13233 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC39.48■■■■□ 3.91
MAP3K1Q13233 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
MAP3K1Q13233 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.47■■■■□ 3.91
MAP3K1Q13233 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
MAP3K1Q13233 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
MAP3K1Q13233 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
MAP3K1Q13233 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC39.46■■■■□ 3.91
MAP3K1Q13233 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
MAP3K1Q13233 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
MAP3K1Q13233 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC39.45■■■■□ 3.91
MAP3K1Q13233 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
MAP3K1Q13233 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
MAP3K1Q13233 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
MAP3K1Q13233 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC39.44■■■■□ 3.9
MAP3K1Q13233 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
MAP3K1Q13233 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
MAP3K1Q13233 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
MAP3K1Q13233 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
MAP3K1Q13233 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC39.42■■■■□ 3.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.4 ms