Protein–RNA interactions for Protein: Q13200

PSMD2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD2Q13200 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSMD2Q13200 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSMD2Q13200 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSMD2Q13200 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSMD2Q13200 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
PSMD2Q13200 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSMD2Q13200 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSMD2Q13200 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSMD2Q13200 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSMD2Q13200 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSMD2Q13200 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSMD2Q13200 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSMD2Q13200 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSMD2Q13200 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSMD2Q13200 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSMD2Q13200 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSMD2Q13200 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSMD2Q13200 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSMD2Q13200 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSMD2Q13200 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSMD2Q13200 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSMD2Q13200 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSMD2Q13200 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSMD2Q13200 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSMD2Q13200 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSMD2Q13200 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSMD2Q13200 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSMD2Q13200 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSMD2Q13200 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSMD2Q13200 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSMD2Q13200 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PSMD2Q13200 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PSMD2Q13200 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSMD2Q13200 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSMD2Q13200 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSMD2Q13200 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSMD2Q13200 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSMD2Q13200 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSMD2Q13200 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PSMD2Q13200 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSMD2Q13200 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSMD2Q13200 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSMD2Q13200 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSMD2Q13200 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSMD2Q13200 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSMD2Q13200 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSMD2Q13200 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSMD2Q13200 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSMD2Q13200 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSMD2Q13200 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSMD2Q13200 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSMD2Q13200 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSMD2Q13200 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSMD2Q13200 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSMD2Q13200 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PSMD2Q13200 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSMD2Q13200 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSMD2Q13200 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSMD2Q13200 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSMD2Q13200 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSMD2Q13200 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSMD2Q13200 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSMD2Q13200 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSMD2Q13200 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSMD2Q13200 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSMD2Q13200 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSMD2Q13200 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSMD2Q13200 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSMD2Q13200 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSMD2Q13200 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PSMD2Q13200 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PSMD2Q13200 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PSMD2Q13200 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PSMD2Q13200 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PSMD2Q13200 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSMD2Q13200 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSMD2Q13200 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSMD2Q13200 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMD2Q13200 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMD2Q13200 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMD2Q13200 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMD2Q13200 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMD2Q13200 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSMD2Q13200 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSMD2Q13200 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSMD2Q13200 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSMD2Q13200 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSMD2Q13200 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSMD2Q13200 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSMD2Q13200 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSMD2Q13200 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSMD2Q13200 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSMD2Q13200 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PSMD2Q13200 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSMD2Q13200 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMD2Q13200 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
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