Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPS1Q13098 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPS1Q13098 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPS1Q13098 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPS1Q13098 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPS1Q13098 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPS1Q13098 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
GPS1Q13098 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPS1Q13098 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPS1Q13098 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPS1Q13098 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPS1Q13098 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPS1Q13098 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPS1Q13098 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPS1Q13098 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GPS1Q13098 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPS1Q13098 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPS1Q13098 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPS1Q13098 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPS1Q13098 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPS1Q13098 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPS1Q13098 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPS1Q13098 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GPS1Q13098 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPS1Q13098 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPS1Q13098 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GPS1Q13098 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GPS1Q13098 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GPS1Q13098 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GPS1Q13098 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GPS1Q13098 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GPS1Q13098 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GPS1Q13098 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GPS1Q13098 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GPS1Q13098 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GPS1Q13098 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPS1Q13098 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPS1Q13098 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GPS1Q13098 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPS1Q13098 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GPS1Q13098 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPS1Q13098 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPS1Q13098 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPS1Q13098 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPS1Q13098 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPS1Q13098 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPS1Q13098 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPS1Q13098 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GPS1Q13098 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPS1Q13098 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GPS1Q13098 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPS1Q13098 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPS1Q13098 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPS1Q13098 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPS1Q13098 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPS1Q13098 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPS1Q13098 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPS1Q13098 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPS1Q13098 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPS1Q13098 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPS1Q13098 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPS1Q13098 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPS1Q13098 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPS1Q13098 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPS1Q13098 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPS1Q13098 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GPS1Q13098 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPS1Q13098 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPS1Q13098 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPS1Q13098 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GPS1Q13098 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GPS1Q13098 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPS1Q13098 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPS1Q13098 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPS1Q13098 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GPS1Q13098 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPS1Q13098 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPS1Q13098 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPS1Q13098 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPS1Q13098 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPS1Q13098 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPS1Q13098 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPS1Q13098 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPS1Q13098 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPS1Q13098 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPS1Q13098 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPS1Q13098 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPS1Q13098 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPS1Q13098 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPS1Q13098 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPS1Q13098 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPS1Q13098 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GPS1Q13098 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPS1Q13098 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPS1Q13098 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPS1Q13098 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPS1Q13098 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPS1Q13098 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPS1Q13098 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPS1Q13098 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
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