Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB40BQ12829 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB40BQ12829 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB40BQ12829 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB40BQ12829 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB40BQ12829 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB40BQ12829 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB40BQ12829 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB40BQ12829 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB40BQ12829 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB40BQ12829 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB40BQ12829 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB40BQ12829 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB40BQ12829 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB40BQ12829 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB40BQ12829 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB40BQ12829 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB40BQ12829 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB40BQ12829 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB40BQ12829 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB40BQ12829 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB40BQ12829 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB40BQ12829 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB40BQ12829 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB40BQ12829 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB40BQ12829 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB40BQ12829 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB40BQ12829 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB40BQ12829 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB40BQ12829 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB40BQ12829 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB40BQ12829 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB40BQ12829 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB40BQ12829 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB40BQ12829 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB40BQ12829 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB40BQ12829 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB40BQ12829 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB40BQ12829 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB40BQ12829 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB40BQ12829 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB40BQ12829 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB40BQ12829 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB40BQ12829 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB40BQ12829 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB40BQ12829 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB40BQ12829 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB40BQ12829 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB40BQ12829 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB40BQ12829 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB40BQ12829 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB40BQ12829 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB40BQ12829 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB40BQ12829 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB40BQ12829 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB40BQ12829 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB40BQ12829 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB40BQ12829 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB40BQ12829 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB40BQ12829 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB40BQ12829 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB40BQ12829 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB40BQ12829 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB40BQ12829 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB40BQ12829 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB40BQ12829 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB40BQ12829 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB40BQ12829 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB40BQ12829 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB40BQ12829 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB40BQ12829 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB40BQ12829 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB40BQ12829 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB40BQ12829 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB40BQ12829 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
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RAB40BQ12829 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB40BQ12829 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB40BQ12829 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB40BQ12829 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB40BQ12829 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB40BQ12829 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB40BQ12829 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB40BQ12829 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB40BQ12829 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB40BQ12829 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB40BQ12829 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB40BQ12829 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB40BQ12829 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB40BQ12829 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB40BQ12829 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB40BQ12829 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RAB40BQ12829 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB40BQ12829 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB40BQ12829 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB40BQ12829 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB40BQ12829 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB40BQ12829 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB40BQ12829 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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