Protein–RNA interactions for Protein: Q12378

RTR2, RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RTR2, yeastyeast

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTR2Q12378 RFS1YBR052C 633 nt7.08□□□□□ -1.28
RTR2Q12378 LEU2YCL018W 1095 nt7.08□□□□□ -1.28
RTR2Q12378 YER152W-AYER152W-A 567 nt7.07□□□□□ -1.28
RTR2Q12378 CKB1YGL019W 837 nt7.07□□□□□ -1.28
RTR2Q12378 YJR149WYJR149W 1215 nt7.07□□□□□ -1.28
RTR2Q12378 CYC3YAL039C 810 nt7.07□□□□□ -1.28
RTR2Q12378 YJL045WYJL045W 1905 nt7.07□□□□□ -1.28
RTR2Q12378 RUP1YOR138C 2016 nt7.06□□□□□ -1.28
RTR2Q12378 PDC5YLR134W 1692 nt7.06□□□□□ -1.28
RTR2Q12378 SRP54YPR088C 1626 nt7.06□□□□□ -1.28
RTR2Q12378 SMC5YOL034W 3282 nt7.05□□□□□ -1.28
RTR2Q12378 AVL9YLR114C 2295 nt7.05□□□□□ -1.28
RTR2Q12378 SER2YGR208W 930 nt7.05□□□□□ -1.28
RTR2Q12378 MOB1YIL106W 945 nt7.05□□□□□ -1.28
RTR2Q12378 YMR007WYMR007W 381 nt7.05□□□□□ -1.28
RTR2Q12378 MRP7YNL005C 1116 nt7.05□□□□□ -1.28
RTR2Q12378 YOR041CYOR041C 432 nt7.05□□□□□ -1.28
RTR2Q12378 RMD8YFR048W 1989 nt7.05□□□□□ -1.28
RTR2Q12378 BUB2YMR055C 921 nt7.04□□□□□ -1.28
RTR2Q12378 PEX28YHR150W 1740 nt7.04□□□□□ -1.28
RTR2Q12378 ICL2YPR006C 1728 nt7.04□□□□□ -1.28
RTR2Q12378 YOR389WYOR389W 1875 nt7.03□□□□□ -1.28
RTR2Q12378 YKR012CYKR012C 378 nt7.03□□□□□ -1.28
RTR2Q12378 HTS1YPR033C 1641 nt7.02□□□□□ -1.29
RTR2Q12378 RCR1YBR005W 642 nt7.02□□□□□ -1.29
RTR2Q12378 TOS2YGR221C 1869 nt7.01□□□□□ -1.29
RTR2Q12378 NAM8YHR086W 1572 nt7.01□□□□□ -1.29
RTR2Q12378 YIR035CYIR035C 765 nt7.01□□□□□ -1.29
RTR2Q12378 PPZ2YDR436W 2133 nt7.01□□□□□ -1.29
RTR2Q12378 DIP5YPL265W 1827 nt7.01□□□□□ -1.29
RTR2Q12378 SDS24YBR214W 1584 nt7□□□□□ -1.29
RTR2Q12378 SRP102YKL154W 735 nt7□□□□□ -1.29
RTR2Q12378 SSC1YJR045C 1965 nt7□□□□□ -1.29
RTR2Q12378 CDC23YHR166C 1881 nt7□□□□□ -1.29
RTR2Q12378 ACO1YLR304C 2337 nt6.99□□□□□ -1.29
RTR2Q12378 RCF2YNR018W 675 nt6.99□□□□□ -1.29
RTR2Q12378 AGP2YBR132C 1791 nt6.99□□□□□ -1.29
RTR2Q12378 VTS1YOR359W 1572 nt6.99□□□□□ -1.29
RTR2Q12378 SRF1YDL133W 1314 nt6.99□□□□□ -1.29
RTR2Q12378 TPO1YLL028W 1761 nt6.98□□□□□ -1.29
RTR2Q12378 GTS1YGL181W 1191 nt6.98□□□□□ -1.29
RTR2Q12378 HRA1HRA1 564 nt6.98□□□□□ -1.29
RTR2Q12378 HSM3YBR272C 1443 nt6.98□□□□□ -1.29
RTR2Q12378 ENO1YGR254W 1314 nt6.98□□□□□ -1.29
RTR2Q12378 VBA3YCL069W 1377 nt6.96□□□□□ -1.29
RTR2Q12378 REX2YLR059C 810 nt6.96□□□□□ -1.3
RTR2Q12378 BUD20YLR074C 501 nt6.96□□□□□ -1.3
RTR2Q12378 YBL113CYBL113C 2379 nt6.95□□□□□ -1.3
RTR2Q12378 YGR210CYGR210C 1236 nt6.95□□□□□ -1.3
RTR2Q12378 SNA3YJL151C 402 nt6.95□□□□□ -1.3
RTR2Q12378 TES1YJR019C 1050 nt6.95□□□□□ -1.3
RTR2Q12378 ERO1YML130C 1692 nt6.95□□□□□ -1.3
RTR2Q12378 DCR2YLR361C 1737 nt6.95□□□□□ -1.3
RTR2Q12378 CAN1YEL063C 1773 nt6.95□□□□□ -1.3
RTR2Q12378 ARO3YDR035W 1113 nt6.94□□□□□ -1.3
RTR2Q12378 YGR137WYGR137W 375 nt6.94□□□□□ -1.3
RTR2Q12378 MEU1YLR017W 1014 nt6.94□□□□□ -1.3
RTR2Q12378 YLR280CYLR280C 351 nt6.94□□□□□ -1.3
RTR2Q12378 WSC3YOL105C 1671 nt6.93□□□□□ -1.3
RTR2Q12378 ELP6YMR312W 822 nt6.93□□□□□ -1.3
RTR2Q12378 YPT11YNL304W 1254 nt6.93□□□□□ -1.3
RTR2Q12378 EHT1YBR177C 1356 nt6.93□□□□□ -1.3
RTR2Q12378 CRN1YLR429W 1956 nt6.92□□□□□ -1.3
RTR2Q12378 CDA1YLR307W 906 nt6.92□□□□□ -1.3
RTR2Q12378 ALG7YBR243C 1347 nt6.92□□□□□ -1.3
RTR2Q12378 FLC2YAL053W 2352 nt6.91□□□□□ -1.3
RTR2Q12378 PRP2YNR011C 2631 nt6.91□□□□□ -1.3
RTR2Q12378 TGA1tA(UGC)A 73 nt6.91□□□□□ -1.3
RTR2Q12378 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt6.91□□□□□ -1.3
RTR2Q12378 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt6.91□□□□□ -1.3
RTR2Q12378 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt6.91□□□□□ -1.3
RTR2Q12378 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt6.91□□□□□ -1.3
RTR2Q12378 MTC6YHR151C 1581 nt6.91□□□□□ -1.3
RTR2Q12378 YFR020WYFR020W 699 nt6.89□□□□□ -1.31
RTR2Q12378 YOR343CYOR343C 327 nt6.89□□□□□ -1.31
RTR2Q12378 YPL108WYPL108W 507 nt6.89□□□□□ -1.31
RTR2Q12378 LEO1YOR123C 1395 nt6.89□□□□□ -1.31
RTR2Q12378 ADE17YMR120C 1779 nt6.89□□□□□ -1.31
RTR2Q12378 ENB1YOL158C 1821 nt6.89□□□□□ -1.31
RTR2Q12378 RQC1YDR333C 2172 nt6.88□□□□□ -1.31
RTR2Q12378 YJL043WYJL043W 774 nt6.88□□□□□ -1.31
RTR2Q12378 RCF1YML030W 480 nt6.88□□□□□ -1.31
RTR2Q12378 PAU21YOR394W 495 nt6.88□□□□□ -1.31
RTR2Q12378 PAU22YPL282C 495 nt6.88□□□□□ -1.31
RTR2Q12378 FCY1YPR062W 477 nt6.88□□□□□ -1.31
RTR2Q12378 PAC10YGR078C 600 nt6.86□□□□□ -1.31
RTR2Q12378 KIN1YDR122W 3195 nt6.85□□□□□ -1.31
RTR2Q12378 ERG12YMR208W 1332 nt6.85□□□□□ -1.31
RTR2Q12378 HHY1YEL059W 309 nt6.85□□□□□ -1.31
RTR2Q12378 SNF4YGL115W 969 nt6.85□□□□□ -1.31
RTR2Q12378 AIM2YAL049C 741 nt6.85□□□□□ -1.31
RTR2Q12378 TCB1YOR086C 3561 nt6.85□□□□□ -1.31
RTR2Q12378 SEC23YPR181C 2307 nt6.84□□□□□ -1.31
RTR2Q12378 NMD5YJR132W 3147 nt6.84□□□□□ -1.31
RTR2Q12378 SGE1YPR198W 1632 nt6.84□□□□□ -1.31
RTR2Q12378 GRH1YDR517W 1119 nt6.84□□□□□ -1.31
RTR2Q12378 YJL160CYJL160C 864 nt6.84□□□□□ -1.31
RTR2Q12378 YOR012WYOR012W 414 nt6.84□□□□□ -1.31
RTR2Q12378 MSS51YLR203C 1311 nt6.82□□□□□ -1.32
RTR2Q12378 TPI1YDR050C 747 nt6.82□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.3 ms