RNA–Protein interactions for RNA: YOR343C

YOR343C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YOR343C, Length 327 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YOR343CYOR343C INO80P53115 1489 aa17.63■□□□□ 0.41
YOR343CYOR343C MON2P48563 1636 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
YOR343CYOR343C DNA2P38859 1522 aa16.78■□□□□ 0.28
YOR343CYOR343C SWR1Q05471 1514 aa16.6■□□□□ 0.25
YOR343CYOR343C KOG1P38873 1557 aa16.47■□□□□ 0.23
YOR343CYOR343C RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
YOR343CYOR343C TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
YOR343CYOR343C TY1B-DR4Q07793 1604 aa16.27■□□□□ 0.19
YOR343CYOR343C SGS1P35187 1447 aa15.84■□□□□ 0.13
YOR343CYOR343C SPT6P23615 1451 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
YOR343CYOR343C HSL1P34244 1518 aa15.65■□□□□ 0.1
YOR343CYOR343C MTC1P47018 478 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
YOR343CYOR343C SPA2P23201 1466 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
YOR343CYOR343C ECM5Q03214 1411 aa15.52■□□□□ 0.08
YOR343CYOR343C BUD4P47136 1447 aa15.32■□□□□ 0.04
YOR343CYOR343C HIR3P47171 1648 aa15.3■□□□□ 0.04
YOR343CYOR343C THO2P53552 1597 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
YOR343CYOR343C MDS3P53094 1487 aa15.2■□□□□ 0.02
YOR343CYOR343C REV3P14284 1504 aa15□□□□□ -0.01
YOR343CYOR343C XRN1P22147 1528 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
YOR343CYOR343C PEP1P32319 1579 aa14.96□□□□□ -0.01
YOR343CYOR343C BPT1P14772 1559 aa14.85□□□□□ -0.03
YOR343CYOR343C ATG2P53855 1592 aa14.81□□□□□ -0.04
YOR343CYOR343C SKI3P17883 1432 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
YOR343CYOR343C TAF2P23255 1407 aa14.6□□□□□ -0.07
YOR343CYOR343C YCF1P39109 1515 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
YOR343CYOR343C SSK2P53599 1579 aa14.47□□□□□ -0.09
YOR343CYOR343C MIF2P35201 549 aa14.46□□□□□ -0.09
YOR343CYOR343C SIN3P22579 1536 aa14.41□□□□□ -0.1
YOR343CYOR343C SSN2P38931 1420 aa14.38□□□□□ -0.11
YOR343CYOR343C UFD4P33202 1483 aa14.34□□□□□ -0.11
YOR343CYOR343C ESP1Q03018 1630 aa14.27□□□□□ -0.12
YOR343CYOR343C MET5P47169 1442 aa14.18□□□□□ -0.14
YOR343CYOR343C RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
YOR343CYOR343C CHD1P32657 1468 aa14.14□□□□□ -0.15
YOR343CYOR343C SCC2Q04002 1493 aa14.14□□□□□ -0.15
YOR343CYOR343C ESC1Q03661 1658 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
YOR343CYOR343C CDC25P04821 1589 aa14.13□□□□□ -0.15
YOR343CYOR343C MYO2P19524 1574 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
YOR343CYOR343C DNF1P32660 1571 aa14.13□□□□□ -0.15
YOR343CYOR343C LTE1P07866 1435 aa14.12□□□□□ -0.15
YOR343CYOR343C YPK9Q12697 1472 aa14.09□□□□□ -0.15
YOR343CYOR343C RPO31P04051 1460 aa14.03□□□□□ -0.16
YOR343CYOR343C RPA190P10964 1664 aaKnown RBP14.02□□□□□ -0.16
YOR343CYOR343C RKR1Q04781 1562 aa14.01□□□□□ -0.17
YOR343CYOR343C ABP1P15891 592 aaKnown RBP14.01□□□□□ -0.17
YOR343CYOR343C BNI1P41832 1953 aa14.01□□□□□ -0.17
YOR343CYOR343C ITT1Q04638 464 aa13.98□□□□□ -0.17
YOR343CYOR343C TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa13.98□□□□□ -0.17
YOR343CYOR343C TY2B-FP0CX63 1770 aa13.98□□□□□ -0.17
YOR343CYOR343C TY2B-GR2P0CX64 1770 aa13.98□□□□□ -0.17
YOR343CYOR343C TY2B-CP25384 1770 aa13.98□□□□□ -0.17
YOR343CYOR343C TY2B-DR2Q03494 1770 aa13.98□□□□□ -0.17
YOR343CYOR343C TY1B-DR1Q03855 1755 aa13.98□□□□□ -0.17
YOR343CYOR343C TY2B-DR3Q07791 1770 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
YOR343CYOR343C TY2B-OR1Q12113 1770 aa13.98□□□□□ -0.17
YOR343CYOR343C TY2B-DR1Q12472 1770 aa13.98□□□□□ -0.17
YOR343CYOR343C TY2B-OR2Q12501 1770 aa13.98□□□□□ -0.17
YOR343CYOR343C PAN1P32521 1480 aa13.98□□□□□ -0.17
YOR343CYOR343C TY1B-BRQ12193 1756 aa13.97□□□□□ -0.17
YOR343CYOR343C TY1B-GR3Q12316 1755 aa13.97□□□□□ -0.17
YOR343CYOR343C TY1B-ORQ92393 1755 aa13.97□□□□□ -0.17
YOR343CYOR343C DRS1P32892 752 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
YOR343CYOR343C YFR006WP43590 535 aa13.97□□□□□ -0.17
YOR343CYOR343C GEA2P39993 1459 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
YOR343CYOR343C MMS1Q06211 1407 aa13.82□□□□□ -0.2
YOR343CYOR343C TY1B-HO13535 1793 aa13.79□□□□□ -0.2
YOR343CYOR343C TY1B-DR5P0C2I2 1755 aa13.79□□□□□ -0.2
YOR343CYOR343C TY1B-DR6P0C2I3 1755 aa13.79□□□□□ -0.2
YOR343CYOR343C TY1B-LR2P0C2I5 1755 aa13.79□□□□□ -0.2
YOR343CYOR343C TY1B-LR3P0C2I6 1755 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
YOR343CYOR343C TY1B-PR1P0C2I9 1755 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
YOR343CYOR343C TY1B-PR2P0C2J0 1756 aa13.79□□□□□ -0.2
YOR343CYOR343C TY1B-PR3P0C2J1 1755 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
YOR343CYOR343C TY1B-JR1P47098 1755 aa13.79□□□□□ -0.2
YOR343CYOR343C TY1B-ML2Q03434 1755 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
YOR343CYOR343C TY1B-ER1Q03612 1755 aa13.79□□□□□ -0.2
YOR343CYOR343C TY1B-ML1Q04711 1755 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
YOR343CYOR343C TY1B-GR2Q12269 1755 aa13.79□□□□□ -0.2
YOR343CYOR343C TY1B-OLQ12273 1755 aa13.79□□□□□ -0.2
YOR343CYOR343C TY1B-PLQ12414 1755 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
YOR343CYOR343C TY2B-BQ12491 1770 aa13.78□□□□□ -0.2
YOR343CYOR343C TOP2P06786 1428 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
YOR343CYOR343C TRM732Q03496 1420 aa13.78□□□□□ -0.2
YOR343CYOR343C MMS22Q06164 1454 aa13.77□□□□□ -0.21
YOR343CYOR343C DRS2P39524 1355 aa13.71□□□□□ -0.21
YOR343CYOR343C TY1B-DR3Q99231 1755 aa13.71□□□□□ -0.21
YOR343CYOR343C YRF1-1P0CX20 1796 aa13.66□□□□□ -0.22
YOR343CYOR343C YRF1-5P0CX21 1796 aa13.66□□□□□ -0.22
YOR343CYOR343C YRF1-8P0CX22 1796 aa13.66□□□□□ -0.22
YOR343CYOR343C NUP159P40477 1460 aa13.65□□□□□ -0.22
YOR343CYOR343C VPS15P22219 1454 aa13.63□□□□□ -0.23
YOR343CYOR343C IRC20Q06554 1556 aa13.62□□□□□ -0.23
YOR343CYOR343C SPP41P38904 1435 aa13.55□□□□□ -0.24
YOR343CYOR343C POL1P13382 1468 aa13.5□□□□□ -0.25
YOR343CYOR343C TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
YOR343CYOR343C TY1B-ER2Q03619 1755 aa13.5□□□□□ -0.25
YOR343CYOR343C TY1B-MR1Q04214 1755 aa13.5□□□□□ -0.25
YOR343CYOR343C TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
YOR343CYOR343C TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
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