Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
GOLGA3Q08378 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
GOLGA3Q08378 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
GOLGA3Q08378 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
GOLGA3Q08378 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
GOLGA3Q08378 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
GOLGA3Q08378 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
GOLGA3Q08378 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
GOLGA3Q08378 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC41.77■■■■■ 4.28
GOLGA3Q08378 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
GOLGA3Q08378 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
GOLGA3Q08378 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC41.76■■■■■ 4.28
GOLGA3Q08378 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC41.75■■■■■ 4.27
GOLGA3Q08378 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
GOLGA3Q08378 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.74■■■■■ 4.27
GOLGA3Q08378 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
GOLGA3Q08378 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC41.73■■■■■ 4.27
GOLGA3Q08378 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
GOLGA3Q08378 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
GOLGA3Q08378 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
GOLGA3Q08378 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.71■■■■■ 4.27
GOLGA3Q08378 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
GOLGA3Q08378 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
GOLGA3Q08378 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC41.7■■■■■ 4.27
GOLGA3Q08378 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC41.7■■■■■ 4.27
GOLGA3Q08378 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
GOLGA3Q08378 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
GOLGA3Q08378 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
GOLGA3Q08378 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
GOLGA3Q08378 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
GOLGA3Q08378 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
GOLGA3Q08378 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
GOLGA3Q08378 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC41.68■■■■■ 4.26
GOLGA3Q08378 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
GOLGA3Q08378 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC41.67■■■■■ 4.26
GOLGA3Q08378 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
GOLGA3Q08378 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
GOLGA3Q08378 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
GOLGA3Q08378 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
GOLGA3Q08378 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC41.65■■■■■ 4.26
GOLGA3Q08378 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC41.64■■■■■ 4.26
GOLGA3Q08378 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
GOLGA3Q08378 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC41.63■■■■■ 4.26
GOLGA3Q08378 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC41.63■■■■■ 4.25
GOLGA3Q08378 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC41.63■■■■■ 4.25
GOLGA3Q08378 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC41.62■■■■■ 4.25
GOLGA3Q08378 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
GOLGA3Q08378 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
GOLGA3Q08378 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
GOLGA3Q08378 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
GOLGA3Q08378 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
GOLGA3Q08378 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
GOLGA3Q08378 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.61■■■■■ 4.25
GOLGA3Q08378 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC41.61■■■■■ 4.25
GOLGA3Q08378 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC41.61■■■■■ 4.25
GOLGA3Q08378 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
GOLGA3Q08378 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
GOLGA3Q08378 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
GOLGA3Q08378 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
GOLGA3Q08378 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
GOLGA3Q08378 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC41.6■■■■■ 4.25
GOLGA3Q08378 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
GOLGA3Q08378 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
GOLGA3Q08378 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
GOLGA3Q08378 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.58■■■■■ 4.25
GOLGA3Q08378 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC41.58■■■■■ 4.25
GOLGA3Q08378 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.25
GOLGA3Q08378 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
GOLGA3Q08378 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.25
GOLGA3Q08378 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
GOLGA3Q08378 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC41.57■■■■■ 4.25
GOLGA3Q08378 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC41.57■■■■■ 4.24
GOLGA3Q08378 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
GOLGA3Q08378 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC41.55■■■■■ 4.24
GOLGA3Q08378 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
GOLGA3Q08378 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC41.54■■■■■ 4.24
GOLGA3Q08378 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
GOLGA3Q08378 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
GOLGA3Q08378 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.53■■■■■ 4.24
GOLGA3Q08378 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
GOLGA3Q08378 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
GOLGA3Q08378 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
GOLGA3Q08378 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC41.51■■■■■ 4.24
GOLGA3Q08378 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
GOLGA3Q08378 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.23
GOLGA3Q08378 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
GOLGA3Q08378 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
GOLGA3Q08378 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
GOLGA3Q08378 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
GOLGA3Q08378 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
GOLGA3Q08378 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC41.45■■■■■ 4.23
GOLGA3Q08378 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
GOLGA3Q08378 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
GOLGA3Q08378 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.22
GOLGA3Q08378 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
GOLGA3Q08378 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC41.42■■■■■ 4.22
GOLGA3Q08378 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
GOLGA3Q08378 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
GOLGA3Q08378 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
GOLGA3Q08378 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms