Protein–RNA interactions for Protein: Q04671

OCA2, P protein, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OCA2Q04671 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
OCA2Q04671 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OCA2Q04671 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OCA2Q04671 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OCA2Q04671 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OCA2Q04671 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
OCA2Q04671 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
OCA2Q04671 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
OCA2Q04671 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OCA2Q04671 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OCA2Q04671 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OCA2Q04671 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OCA2Q04671 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OCA2Q04671 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OCA2Q04671 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OCA2Q04671 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OCA2Q04671 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OCA2Q04671 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
OCA2Q04671 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OCA2Q04671 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OCA2Q04671 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OCA2Q04671 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OCA2Q04671 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OCA2Q04671 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OCA2Q04671 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OCA2Q04671 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
OCA2Q04671 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OCA2Q04671 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OCA2Q04671 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OCA2Q04671 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OCA2Q04671 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OCA2Q04671 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OCA2Q04671 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OCA2Q04671 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OCA2Q04671 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OCA2Q04671 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OCA2Q04671 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OCA2Q04671 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OCA2Q04671 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OCA2Q04671 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OCA2Q04671 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OCA2Q04671 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OCA2Q04671 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OCA2Q04671 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OCA2Q04671 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
OCA2Q04671 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OCA2Q04671 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
OCA2Q04671 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OCA2Q04671 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OCA2Q04671 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OCA2Q04671 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OCA2Q04671 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OCA2Q04671 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OCA2Q04671 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OCA2Q04671 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OCA2Q04671 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OCA2Q04671 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OCA2Q04671 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
OCA2Q04671 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
OCA2Q04671 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OCA2Q04671 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OCA2Q04671 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OCA2Q04671 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OCA2Q04671 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OCA2Q04671 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OCA2Q04671 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OCA2Q04671 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OCA2Q04671 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OCA2Q04671 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OCA2Q04671 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OCA2Q04671 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
OCA2Q04671 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OCA2Q04671 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OCA2Q04671 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OCA2Q04671 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OCA2Q04671 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OCA2Q04671 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OCA2Q04671 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OCA2Q04671 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OCA2Q04671 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OCA2Q04671 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OCA2Q04671 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
OCA2Q04671 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
OCA2Q04671 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OCA2Q04671 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OCA2Q04671 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OCA2Q04671 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OCA2Q04671 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
OCA2Q04671 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OCA2Q04671 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OCA2Q04671 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OCA2Q04671 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OCA2Q04671 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OCA2Q04671 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OCA2Q04671 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OCA2Q04671 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OCA2Q04671 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OCA2Q04671 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OCA2Q04671 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OCA2Q04671 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms