Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPCQ03188 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPCQ03188 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPCQ03188 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPCQ03188 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CENPCQ03188 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPCQ03188 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPCQ03188 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPCQ03188 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPCQ03188 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPCQ03188 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPCQ03188 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPCQ03188 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CENPCQ03188 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPCQ03188 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPCQ03188 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPCQ03188 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPCQ03188 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPCQ03188 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPCQ03188 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CENPCQ03188 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CENPCQ03188 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CENPCQ03188 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CENPCQ03188 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CENPCQ03188 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CENPCQ03188 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CENPCQ03188 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CENPCQ03188 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CENPCQ03188 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CENPCQ03188 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CENPCQ03188 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CENPCQ03188 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CENPCQ03188 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CENPCQ03188 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CENPCQ03188 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CENPCQ03188 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CENPCQ03188 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CENPCQ03188 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CENPCQ03188 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CENPCQ03188 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CENPCQ03188 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CENPCQ03188 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CENPCQ03188 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CENPCQ03188 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CENPCQ03188 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CENPCQ03188 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CENPCQ03188 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CENPCQ03188 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CENPCQ03188 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPCQ03188 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPCQ03188 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPCQ03188 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPCQ03188 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPCQ03188 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CENPCQ03188 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CENPCQ03188 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPCQ03188 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPCQ03188 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPCQ03188 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPCQ03188 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPCQ03188 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPCQ03188 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPCQ03188 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CENPCQ03188 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CENPCQ03188 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CENPCQ03188 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CENPCQ03188 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPCQ03188 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPCQ03188 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPCQ03188 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPCQ03188 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPCQ03188 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPCQ03188 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPCQ03188 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPCQ03188 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPCQ03188 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPCQ03188 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPCQ03188 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPCQ03188 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPCQ03188 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CENPCQ03188 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CENPCQ03188 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CENPCQ03188 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CENPCQ03188 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CENPCQ03188 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CENPCQ03188 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CENPCQ03188 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CENPCQ03188 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPCQ03188 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPCQ03188 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPCQ03188 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPCQ03188 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPCQ03188 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPCQ03188 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPCQ03188 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPCQ03188 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPCQ03188 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPCQ03188 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPCQ03188 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPCQ03188 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms