Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYP27A1Q02318 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYP27A1Q02318 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYP27A1Q02318 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYP27A1Q02318 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYP27A1Q02318 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CYP27A1Q02318 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CYP27A1Q02318 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CYP27A1Q02318 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CYP27A1Q02318 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CYP27A1Q02318 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CYP27A1Q02318 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CYP27A1Q02318 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CYP27A1Q02318 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CYP27A1Q02318 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CYP27A1Q02318 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CYP27A1Q02318 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CYP27A1Q02318 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CYP27A1Q02318 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CYP27A1Q02318 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYP27A1Q02318 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYP27A1Q02318 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYP27A1Q02318 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CYP27A1Q02318 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYP27A1Q02318 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYP27A1Q02318 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYP27A1Q02318 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CYP27A1Q02318 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYP27A1Q02318 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYP27A1Q02318 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYP27A1Q02318 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYP27A1Q02318 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYP27A1Q02318 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYP27A1Q02318 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYP27A1Q02318 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYP27A1Q02318 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYP27A1Q02318 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CYP27A1Q02318 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CYP27A1Q02318 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CYP27A1Q02318 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CYP27A1Q02318 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CYP27A1Q02318 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CYP27A1Q02318 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CYP27A1Q02318 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CYP27A1Q02318 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CYP27A1Q02318 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CYP27A1Q02318 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CYP27A1Q02318 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CYP27A1Q02318 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CYP27A1Q02318 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CYP27A1Q02318 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
CYP27A1Q02318 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CYP27A1Q02318 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CYP27A1Q02318 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CYP27A1Q02318 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CYP27A1Q02318 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CYP27A1Q02318 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CYP27A1Q02318 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CYP27A1Q02318 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CYP27A1Q02318 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CYP27A1Q02318 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CYP27A1Q02318 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CYP27A1Q02318 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CYP27A1Q02318 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CYP27A1Q02318 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CYP27A1Q02318 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CYP27A1Q02318 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CYP27A1Q02318 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CYP27A1Q02318 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CYP27A1Q02318 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CYP27A1Q02318 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CYP27A1Q02318 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CYP27A1Q02318 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CYP27A1Q02318 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYP27A1Q02318 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYP27A1Q02318 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYP27A1Q02318 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CYP27A1Q02318 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CYP27A1Q02318 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYP27A1Q02318 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYP27A1Q02318 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYP27A1Q02318 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYP27A1Q02318 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYP27A1Q02318 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYP27A1Q02318 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYP27A1Q02318 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYP27A1Q02318 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYP27A1Q02318 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYP27A1Q02318 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CYP27A1Q02318 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYP27A1Q02318 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYP27A1Q02318 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CYP27A1Q02318 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CYP27A1Q02318 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CYP27A1Q02318 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CYP27A1Q02318 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CYP27A1Q02318 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CYP27A1Q02318 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYP27A1Q02318 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CYP27A1Q02318 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms