Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MDM2Q00987 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MDM2Q00987 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MDM2Q00987 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MDM2Q00987 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MDM2Q00987 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MDM2Q00987 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MDM2Q00987 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MDM2Q00987 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MDM2Q00987 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MDM2Q00987 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MDM2Q00987 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
MDM2Q00987 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MDM2Q00987 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MDM2Q00987 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MDM2Q00987 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MDM2Q00987 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MDM2Q00987 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MDM2Q00987 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MDM2Q00987 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MDM2Q00987 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MDM2Q00987 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MDM2Q00987 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MDM2Q00987 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MDM2Q00987 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MDM2Q00987 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MDM2Q00987 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MDM2Q00987 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MDM2Q00987 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MDM2Q00987 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MDM2Q00987 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MDM2Q00987 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MDM2Q00987 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MDM2Q00987 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MDM2Q00987 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
MDM2Q00987 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
MDM2Q00987 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MDM2Q00987 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MDM2Q00987 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MDM2Q00987 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MDM2Q00987 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MDM2Q00987 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MDM2Q00987 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
MDM2Q00987 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MDM2Q00987 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
MDM2Q00987 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MDM2Q00987 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MDM2Q00987 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MDM2Q00987 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MDM2Q00987 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MDM2Q00987 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MDM2Q00987 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MDM2Q00987 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MDM2Q00987 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MDM2Q00987 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MDM2Q00987 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MDM2Q00987 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MDM2Q00987 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MDM2Q00987 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MDM2Q00987 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MDM2Q00987 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MDM2Q00987 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MDM2Q00987 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MDM2Q00987 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MDM2Q00987 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MDM2Q00987 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MDM2Q00987 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MDM2Q00987 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MDM2Q00987 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MDM2Q00987 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MDM2Q00987 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MDM2Q00987 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MDM2Q00987 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MDM2Q00987 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MDM2Q00987 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MDM2Q00987 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MDM2Q00987 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MDM2Q00987 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MDM2Q00987 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MDM2Q00987 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MDM2Q00987 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MDM2Q00987 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MDM2Q00987 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MDM2Q00987 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MDM2Q00987 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MDM2Q00987 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MDM2Q00987 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MDM2Q00987 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MDM2Q00987 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MDM2Q00987 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MDM2Q00987 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MDM2Q00987 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MDM2Q00987 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MDM2Q00987 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
MDM2Q00987 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MDM2Q00987 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
MDM2Q00987 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MDM2Q00987 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
MDM2Q00987 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MDM2Q00987 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms