Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYBPC1Q00872 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYBPC1Q00872 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYBPC1Q00872 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYBPC1Q00872 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYBPC1Q00872 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYBPC1Q00872 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYBPC1Q00872 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYBPC1Q00872 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYBPC1Q00872 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYBPC1Q00872 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MYBPC1Q00872 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MYBPC1Q00872 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MYBPC1Q00872 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MYBPC1Q00872 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MYBPC1Q00872 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MYBPC1Q00872 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MYBPC1Q00872 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MYBPC1Q00872 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MYBPC1Q00872 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MYBPC1Q00872 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MYBPC1Q00872 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MYBPC1Q00872 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MYBPC1Q00872 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYBPC1Q00872 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYBPC1Q00872 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYBPC1Q00872 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYBPC1Q00872 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYBPC1Q00872 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYBPC1Q00872 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MYBPC1Q00872 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYBPC1Q00872 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYBPC1Q00872 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYBPC1Q00872 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYBPC1Q00872 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYBPC1Q00872 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MYBPC1Q00872 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYBPC1Q00872 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYBPC1Q00872 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MYBPC1Q00872 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYBPC1Q00872 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYBPC1Q00872 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYBPC1Q00872 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MYBPC1Q00872 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYBPC1Q00872 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYBPC1Q00872 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYBPC1Q00872 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYBPC1Q00872 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYBPC1Q00872 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYBPC1Q00872 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYBPC1Q00872 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYBPC1Q00872 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYBPC1Q00872 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYBPC1Q00872 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYBPC1Q00872 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYBPC1Q00872 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYBPC1Q00872 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYBPC1Q00872 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYBPC1Q00872 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYBPC1Q00872 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYBPC1Q00872 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYBPC1Q00872 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYBPC1Q00872 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MYBPC1Q00872 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYBPC1Q00872 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYBPC1Q00872 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYBPC1Q00872 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYBPC1Q00872 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYBPC1Q00872 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYBPC1Q00872 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYBPC1Q00872 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYBPC1Q00872 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYBPC1Q00872 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYBPC1Q00872 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYBPC1Q00872 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MYBPC1Q00872 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
MYBPC1Q00872 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MYBPC1Q00872 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYBPC1Q00872 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYBPC1Q00872 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYBPC1Q00872 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYBPC1Q00872 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYBPC1Q00872 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYBPC1Q00872 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYBPC1Q00872 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYBPC1Q00872 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYBPC1Q00872 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYBPC1Q00872 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYBPC1Q00872 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYBPC1Q00872 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYBPC1Q00872 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYBPC1Q00872 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYBPC1Q00872 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYBPC1Q00872 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYBPC1Q00872 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYBPC1Q00872 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYBPC1Q00872 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYBPC1Q00872 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYBPC1Q00872 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYBPC1Q00872 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms