Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK6Q00534 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK6Q00534 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK6Q00534 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK6Q00534 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK6Q00534 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK6Q00534 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CDK6Q00534 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
CDK6Q00534 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK6Q00534 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK6Q00534 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK6Q00534 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK6Q00534 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK6Q00534 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDK6Q00534 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK6Q00534 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK6Q00534 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDK6Q00534 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK6Q00534 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDK6Q00534 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK6Q00534 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK6Q00534 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK6Q00534 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK6Q00534 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK6Q00534 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDK6Q00534 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK6Q00534 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK6Q00534 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK6Q00534 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDK6Q00534 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK6Q00534 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK6Q00534 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK6Q00534 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK6Q00534 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK6Q00534 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK6Q00534 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK6Q00534 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK6Q00534 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK6Q00534 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK6Q00534 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK6Q00534 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK6Q00534 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK6Q00534 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK6Q00534 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK6Q00534 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK6Q00534 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK6Q00534 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK6Q00534 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK6Q00534 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK6Q00534 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK6Q00534 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK6Q00534 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK6Q00534 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK6Q00534 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK6Q00534 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK6Q00534 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK6Q00534 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK6Q00534 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK6Q00534 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK6Q00534 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK6Q00534 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK6Q00534 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK6Q00534 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK6Q00534 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK6Q00534 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK6Q00534 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK6Q00534 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK6Q00534 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK6Q00534 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK6Q00534 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK6Q00534 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK6Q00534 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK6Q00534 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK6Q00534 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK6Q00534 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK6Q00534 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK6Q00534 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK6Q00534 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK6Q00534 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK6Q00534 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK6Q00534 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK6Q00534 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK6Q00534 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK6Q00534 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK6Q00534 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK6Q00534 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK6Q00534 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK6Q00534 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK6Q00534 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK6Q00534 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK6Q00534 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK6Q00534 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK6Q00534 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK6Q00534 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK6Q00534 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK6Q00534 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK6Q00534 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK6Q00534 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK6Q00534 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK6Q00534 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms