Protein–RNA interactions for Protein: Q00005

PPP2R2B, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2R2BQ00005 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPP2R2BQ00005 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP2R2BQ00005 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPP2R2BQ00005 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP2R2BQ00005 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PPP2R2BQ00005 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP2R2BQ00005 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP2R2BQ00005 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP2R2BQ00005 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP2R2BQ00005 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP2R2BQ00005 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP2R2BQ00005 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP2R2BQ00005 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP2R2BQ00005 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP2R2BQ00005 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP2R2BQ00005 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP2R2BQ00005 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP2R2BQ00005 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP2R2BQ00005 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP2R2BQ00005 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP2R2BQ00005 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP2R2BQ00005 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP2R2BQ00005 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP2R2BQ00005 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP2R2BQ00005 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP2R2BQ00005 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP2R2BQ00005 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP2R2BQ00005 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP2R2BQ00005 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP2R2BQ00005 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP2R2BQ00005 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP2R2BQ00005 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPP2R2BQ00005 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPP2R2BQ00005 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPP2R2BQ00005 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPP2R2BQ00005 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPP2R2BQ00005 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPP2R2BQ00005 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPP2R2BQ00005 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP2R2BQ00005 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP2R2BQ00005 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP2R2BQ00005 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP2R2BQ00005 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP2R2BQ00005 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP2R2BQ00005 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PPP2R2BQ00005 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP2R2BQ00005 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPP2R2BQ00005 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP2R2BQ00005 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP2R2BQ00005 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP2R2BQ00005 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP2R2BQ00005 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP2R2BQ00005 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP2R2BQ00005 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP2R2BQ00005 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP2R2BQ00005 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP2R2BQ00005 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP2R2BQ00005 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP2R2BQ00005 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP2R2BQ00005 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP2R2BQ00005 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP2R2BQ00005 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP2R2BQ00005 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP2R2BQ00005 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP2R2BQ00005 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP2R2BQ00005 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPP2R2BQ00005 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPP2R2BQ00005 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP2R2BQ00005 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP2R2BQ00005 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP2R2BQ00005 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP2R2BQ00005 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP2R2BQ00005 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP2R2BQ00005 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP2R2BQ00005 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP2R2BQ00005 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP2R2BQ00005 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP2R2BQ00005 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP2R2BQ00005 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP2R2BQ00005 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP2R2BQ00005 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP2R2BQ00005 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP2R2BQ00005 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP2R2BQ00005 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP2R2BQ00005 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP2R2BQ00005 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP2R2BQ00005 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP2R2BQ00005 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP2R2BQ00005 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP2R2BQ00005 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP2R2BQ00005 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP2R2BQ00005 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP2R2BQ00005 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP2R2BQ00005 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP2R2BQ00005 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP2R2BQ00005 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP2R2BQ00005 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP2R2BQ00005 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP2R2BQ00005 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP2R2BQ00005 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms