Protein–RNA interactions for Protein: P86397

HTD2, Hydroxyacyl-thioester dehydratase type 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTD2P86397 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTD2P86397 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTD2P86397 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HTD2P86397 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HTD2P86397 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HTD2P86397 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HTD2P86397 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HTD2P86397 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HTD2P86397 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HTD2P86397 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HTD2P86397 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HTD2P86397 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTD2P86397 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTD2P86397 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTD2P86397 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTD2P86397 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HTD2P86397 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTD2P86397 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTD2P86397 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HTD2P86397 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HTD2P86397 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
HTD2P86397 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HTD2P86397 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HTD2P86397 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HTD2P86397 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HTD2P86397 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HTD2P86397 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HTD2P86397 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTD2P86397 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTD2P86397 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTD2P86397 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HTD2P86397 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HTD2P86397 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HTD2P86397 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HTD2P86397 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HTD2P86397 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HTD2P86397 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HTD2P86397 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HTD2P86397 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HTD2P86397 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HTD2P86397 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HTD2P86397 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HTD2P86397 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HTD2P86397 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HTD2P86397 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HTD2P86397 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HTD2P86397 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HTD2P86397 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HTD2P86397 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HTD2P86397 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HTD2P86397 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HTD2P86397 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HTD2P86397 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HTD2P86397 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HTD2P86397 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HTD2P86397 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HTD2P86397 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HTD2P86397 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HTD2P86397 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HTD2P86397 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HTD2P86397 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HTD2P86397 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HTD2P86397 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HTD2P86397 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HTD2P86397 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HTD2P86397 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HTD2P86397 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HTD2P86397 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HTD2P86397 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HTD2P86397 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
HTD2P86397 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HTD2P86397 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HTD2P86397 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HTD2P86397 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HTD2P86397 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HTD2P86397 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HTD2P86397 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HTD2P86397 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HTD2P86397 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HTD2P86397 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HTD2P86397 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HTD2P86397 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HTD2P86397 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HTD2P86397 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HTD2P86397 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HTD2P86397 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HTD2P86397 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HTD2P86397 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HTD2P86397 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HTD2P86397 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HTD2P86397 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HTD2P86397 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HTD2P86397 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HTD2P86397 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HTD2P86397 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HTD2P86397 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HTD2P86397 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HTD2P86397 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HTD2P86397 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HTD2P86397 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms