Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVK11-1P61568 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVK11-1P61568 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVK11-1P61568 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK11-1P61568 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK11-1P61568 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK11-1P61568 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK11-1P61568 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK11-1P61568 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK11-1P61568 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVK11-1P61568 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVK11-1P61568 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVK11-1P61568 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK11-1P61568 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK11-1P61568 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK11-1P61568 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK11-1P61568 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK11-1P61568 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK11-1P61568 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK11-1P61568 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK11-1P61568 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVK11-1P61568 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERVK11-1P61568 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERVK11-1P61568 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVK11-1P61568 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVK11-1P61568 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVK11-1P61568 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVK11-1P61568 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVK11-1P61568 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK11-1P61568 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK11-1P61568 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK11-1P61568 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK11-1P61568 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK11-1P61568 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK11-1P61568 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK11-1P61568 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK11-1P61568 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK11-1P61568 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK11-1P61568 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK11-1P61568 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK11-1P61568 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK11-1P61568 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK11-1P61568 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK11-1P61568 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK11-1P61568 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK11-1P61568 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK11-1P61568 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK11-1P61568 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK11-1P61568 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERVK11-1P61568 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ERVK11-1P61568 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERVK11-1P61568 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK11-1P61568 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK11-1P61568 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ERVK11-1P61568 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK11-1P61568 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK11-1P61568 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK11-1P61568 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK11-1P61568 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK11-1P61568 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK11-1P61568 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK11-1P61568 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK11-1P61568 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK11-1P61568 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK11-1P61568 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK11-1P61568 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK11-1P61568 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK11-1P61568 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK11-1P61568 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK11-1P61568 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK11-1P61568 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK11-1P61568 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ERVK11-1P61568 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK11-1P61568 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK11-1P61568 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK11-1P61568 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK11-1P61568 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK11-1P61568 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK11-1P61568 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK11-1P61568 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK11-1P61568 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK11-1P61568 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK11-1P61568 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK11-1P61568 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK11-1P61568 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK11-1P61568 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK11-1P61568 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK11-1P61568 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK11-1P61568 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERVK11-1P61568 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK11-1P61568 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK11-1P61568 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK11-1P61568 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK11-1P61568 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK11-1P61568 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK11-1P61568 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK11-1P61568 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK11-1P61568 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK11-1P61568 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERVK11-1P61568 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms