Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLDN2P57739 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLDN2P57739 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLDN2P57739 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLDN2P57739 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLDN2P57739 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLDN2P57739 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLDN2P57739 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLDN2P57739 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CLDN2P57739 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLDN2P57739 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN2P57739 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN2P57739 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN2P57739 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN2P57739 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN2P57739 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN2P57739 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLDN2P57739 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLDN2P57739 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLDN2P57739 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLDN2P57739 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLDN2P57739 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLDN2P57739 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLDN2P57739 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLDN2P57739 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLDN2P57739 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLDN2P57739 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLDN2P57739 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLDN2P57739 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLDN2P57739 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLDN2P57739 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLDN2P57739 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLDN2P57739 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLDN2P57739 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLDN2P57739 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLDN2P57739 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CLDN2P57739 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLDN2P57739 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLDN2P57739 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDN2P57739 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDN2P57739 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDN2P57739 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDN2P57739 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDN2P57739 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDN2P57739 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDN2P57739 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDN2P57739 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDN2P57739 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDN2P57739 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDN2P57739 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDN2P57739 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDN2P57739 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CLDN2P57739 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLDN2P57739 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLDN2P57739 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLDN2P57739 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLDN2P57739 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDN2P57739 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLDN2P57739 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLDN2P57739 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLDN2P57739 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CLDN2P57739 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CLDN2P57739 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLDN2P57739 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLDN2P57739 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLDN2P57739 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLDN2P57739 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLDN2P57739 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLDN2P57739 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CLDN2P57739 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLDN2P57739 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLDN2P57739 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLDN2P57739 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDN2P57739 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDN2P57739 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDN2P57739 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDN2P57739 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDN2P57739 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDN2P57739 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDN2P57739 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDN2P57739 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDN2P57739 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDN2P57739 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN2P57739 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN2P57739 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLDN2P57739 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLDN2P57739 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLDN2P57739 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLDN2P57739 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLDN2P57739 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLDN2P57739 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLDN2P57739 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLDN2P57739 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLDN2P57739 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLDN2P57739 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CLDN2P57739 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLDN2P57739 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLDN2P57739 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLDN2P57739 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDN2P57739 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms