Protein–RNA interactions for Protein: P56749

CLDN12, Claudin-12, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN12P56749 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN12P56749 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN12P56749 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN12P56749 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN12P56749 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN12P56749 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN12P56749 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN12P56749 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN12P56749 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN12P56749 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN12P56749 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN12P56749 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN12P56749 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN12P56749 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN12P56749 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN12P56749 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN12P56749 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN12P56749 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN12P56749 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN12P56749 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN12P56749 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN12P56749 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CLDN12P56749 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN12P56749 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN12P56749 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN12P56749 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN12P56749 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN12P56749 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN12P56749 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN12P56749 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN12P56749 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN12P56749 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN12P56749 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN12P56749 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN12P56749 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN12P56749 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN12P56749 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN12P56749 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN12P56749 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN12P56749 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN12P56749 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN12P56749 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN12P56749 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN12P56749 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN12P56749 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN12P56749 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLDN12P56749 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CLDN12P56749 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN12P56749 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN12P56749 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN12P56749 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN12P56749 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN12P56749 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN12P56749 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN12P56749 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN12P56749 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN12P56749 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN12P56749 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN12P56749 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN12P56749 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN12P56749 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN12P56749 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN12P56749 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN12P56749 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN12P56749 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN12P56749 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN12P56749 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN12P56749 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN12P56749 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN12P56749 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN12P56749 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN12P56749 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN12P56749 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLDN12P56749 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLDN12P56749 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN12P56749 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN12P56749 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN12P56749 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN12P56749 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN12P56749 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN12P56749 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN12P56749 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN12P56749 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN12P56749 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN12P56749 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN12P56749 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN12P56749 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN12P56749 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN12P56749 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN12P56749 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN12P56749 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN12P56749 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN12P56749 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN12P56749 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN12P56749 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN12P56749 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN12P56749 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN12P56749 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN12P56749 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN12P56749 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms