Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPTEP56180 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPTEP56180 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPTEP56180 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPTEP56180 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPTEP56180 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPTEP56180 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPTEP56180 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPTEP56180 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPTEP56180 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPTEP56180 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPTEP56180 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPTEP56180 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPTEP56180 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TPTEP56180 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPTEP56180 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPTEP56180 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPTEP56180 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPTEP56180 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPTEP56180 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPTEP56180 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPTEP56180 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPTEP56180 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPTEP56180 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TPTEP56180 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPTEP56180 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPTEP56180 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPTEP56180 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPTEP56180 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPTEP56180 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPTEP56180 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPTEP56180 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPTEP56180 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPTEP56180 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPTEP56180 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPTEP56180 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPTEP56180 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TPTEP56180 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPTEP56180 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TPTEP56180 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPTEP56180 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPTEP56180 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPTEP56180 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPTEP56180 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPTEP56180 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPTEP56180 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPTEP56180 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPTEP56180 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPTEP56180 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TPTEP56180 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPTEP56180 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPTEP56180 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPTEP56180 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPTEP56180 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPTEP56180 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPTEP56180 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPTEP56180 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPTEP56180 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPTEP56180 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPTEP56180 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPTEP56180 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPTEP56180 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPTEP56180 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPTEP56180 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPTEP56180 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPTEP56180 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPTEP56180 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TPTEP56180 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPTEP56180 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPTEP56180 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPTEP56180 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPTEP56180 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TPTEP56180 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPTEP56180 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPTEP56180 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPTEP56180 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPTEP56180 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPTEP56180 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPTEP56180 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPTEP56180 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPTEP56180 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPTEP56180 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPTEP56180 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPTEP56180 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPTEP56180 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPTEP56180 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPTEP56180 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPTEP56180 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TPTEP56180 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPTEP56180 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPTEP56180 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TPTEP56180 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPTEP56180 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPTEP56180 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPTEP56180 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPTEP56180 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPTEP56180 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPTEP56180 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TPTEP56180 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPTEP56180 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms