Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
AFDNP55196 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
AFDNP55196 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
AFDNP55196 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
AFDNP55196 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
AFDNP55196 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
AFDNP55196 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
AFDNP55196 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
AFDNP55196 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
AFDNP55196 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
AFDNP55196 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
AFDNP55196 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
AFDNP55196 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
AFDNP55196 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
AFDNP55196 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
AFDNP55196 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
AFDNP55196 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
AFDNP55196 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
AFDNP55196 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
AFDNP55196 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.8
AFDNP55196 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
AFDNP55196 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
AFDNP55196 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
AFDNP55196 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
AFDNP55196 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
AFDNP55196 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
AFDNP55196 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
AFDNP55196 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
AFDNP55196 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
AFDNP55196 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
AFDNP55196 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
AFDNP55196 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
AFDNP55196 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
AFDNP55196 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
AFDNP55196 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
AFDNP55196 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
AFDNP55196 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
AFDNP55196 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
AFDNP55196 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
AFDNP55196 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
AFDNP55196 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
AFDNP55196 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
AFDNP55196 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
AFDNP55196 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
AFDNP55196 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
AFDNP55196 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
AFDNP55196 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
AFDNP55196 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
AFDNP55196 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
AFDNP55196 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
AFDNP55196 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
AFDNP55196 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
AFDNP55196 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
AFDNP55196 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
AFDNP55196 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
AFDNP55196 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
AFDNP55196 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
AFDNP55196 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
AFDNP55196 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
AFDNP55196 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
AFDNP55196 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
AFDNP55196 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
AFDNP55196 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
AFDNP55196 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
AFDNP55196 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
AFDNP55196 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
AFDNP55196 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
AFDNP55196 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
AFDNP55196 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
AFDNP55196 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
AFDNP55196 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
AFDNP55196 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
AFDNP55196 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
AFDNP55196 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
AFDNP55196 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
AFDNP55196 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
AFDNP55196 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
AFDNP55196 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
AFDNP55196 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
AFDNP55196 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
AFDNP55196 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
AFDNP55196 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
AFDNP55196 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
AFDNP55196 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
AFDNP55196 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
AFDNP55196 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
AFDNP55196 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
AFDNP55196 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
AFDNP55196 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
AFDNP55196 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
AFDNP55196 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
AFDNP55196 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
AFDNP55196 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
AFDNP55196 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
AFDNP55196 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
AFDNP55196 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
AFDNP55196 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
AFDNP55196 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
AFDNP55196 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
AFDNP55196 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms