Protein–RNA interactions for Protein: P49588

AARS, Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AARSP49588 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.453e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PSMD5-AS1-211ENST00000640066 1970 ntTSL 1 (best)17.88■□□□□ 0.453e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TBL1XR1-202ENST00000413084 592 ntTSL 417.86■□□□□ 0.453e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TBL1XR1-206ENST00000427349 554 ntTSL 317.86■□□□□ 0.453e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.453e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.453e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.443e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 MED16-212ENST00000607471 2004 ntTSL 1 (best)17.74■□□□□ 0.433e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PIGQ-221ENST00000636657 2841 ntTSL 517.72■□□□□ 0.433e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 RPL13P5-205ENST00000451612 587 ntTSL 417.71■□□□□ 0.433e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.433e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.413e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.43e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.393e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.393e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TRAPPC9-214ENST00000523777 705 ntTSL 317.46■□□□□ 0.393e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.383e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 NEPRO-218ENST00000489848 1576 ntTSL 217.36■□□□□ 0.379e-8■■■■■ 61.8
AARSP49588 TBL1XR1-210ENST00000431674 559 ntTSL 417.36■□□□□ 0.373e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.363e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.363e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 OGG1-212ENST00000426518 874 ntTSL 517.28■□□□□ 0.363e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.353e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.353e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.353e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.353e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TBL1XR1-213ENST00000450267 588 ntTSL 317.25■□□□□ 0.353e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.343e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 SBNO2-205ENST00000587655 914 ntTSL 317.06■□□□□ 0.323e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.313e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.313e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 AGAP1-214ENST00000635100 2478 ntTSL 516.96■□□□□ 0.313e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.313e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.293e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.293e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.293e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.283e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.283e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.283e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 KIAA1328-210ENST00000592611 1798 ntTSL 216.68■□□□□ 0.263e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PRKRIP1-203ENST00000468316 2045 ntTSL 1 (best)16.67■□□□□ 0.263e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 SLC25A29-220ENST00000557438 534 ntTSL 316.65■□□□□ 0.263e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TMBIM1-205ENST00000420341 361 ntTSL 416.65■□□□□ 0.263e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 AP3M1-204ENST00000487653 550 ntTSL 316.65■□□□□ 0.263e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.263e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.253e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.243e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.233e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ZDHHC17-202ENST00000546778 1146 ntTSL 216.45■□□□□ 0.223e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.223e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 MGA-210ENST00000568630 584 ntTSL 316.42■□□□□ 0.223e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.223e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 RAB40B-203ENST00000570676 1104 ntTSL 216.4■□□□□ 0.223e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.213e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 RTEL1-TNFRSF6B-203ENST00000492259 4824 ntAPPRIS ALT2 TSL 516.35■□□□□ 0.213e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.213e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.213e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 FCHO1-235ENST00000601247 458 ntTSL 416.31■□□□□ 0.23e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.23e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.23e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.23e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.193e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.193e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.193e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.183e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.183e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.173e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 HTRA2-210ENST00000484881 740 ntTSL 516.1■□□□□ 0.173e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.173e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.173e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 HDAC8-213ENST00000436675 908 ntTSL 516.08■□□□□ 0.163e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 MED16-205ENST00000586017 1403 ntTSL 1 (best)16.08■□□□□ 0.163e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.153e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 MANBA-206ENST00000511813 628 ntTSL 416■□□□□ 0.153e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.153e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 HS1BP3-206ENST00000446825 841 ntTSL 315.9■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.123e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ATXN2-218ENST00000549455 568 ntTSL 415.76■□□□□ 0.113e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.113e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 CACTIN-206ENST00000588749 391 ntTSL 315.7■□□□□ 0.13e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 SZRD1-206ENST00000475078 490 ntTSL 415.67■□□□□ 0.13e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.13e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.13e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.093e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.093e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.093e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.093e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 GLG1-206ENST00000562090 4037 ntTSL 215.6■□□□□ 0.093e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 SZRD1-204ENST00000472351 791 ntTSL 415.56■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PAPD5-204ENST00000562717 1866 ntTSL 515.52■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 NEPRO-211ENST00000472637 2179 ntTSL 1 (best)15.5■□□□□ 0.079e-8■■■■■ 61.8
AARSP49588 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.073e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 MANBA-204ENST00000507358 582 ntTSL 315.49■□□□□ 0.073e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 SBNO2-209ENST00000590998 562 ntTSL 415.49■□□□□ 0.073e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 MED16-210ENST00000606248 3181 ntTSL 1 (best)15.43■□□□□ 0.063e-6■■■■■ 61.8
Retrieved 100 of 8,200 protein–RNA pairs in 198.9 ms