Protein–RNA interactions for Protein: P47972

NPTX2, Neuronal pentraxin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX2P47972 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NPTX2P47972 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NPTX2P47972 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NPTX2P47972 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NPTX2P47972 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NPTX2P47972 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NPTX2P47972 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NPTX2P47972 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NPTX2P47972 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NPTX2P47972 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NPTX2P47972 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NPTX2P47972 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NPTX2P47972 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NPTX2P47972 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NPTX2P47972 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NPTX2P47972 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NPTX2P47972 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NPTX2P47972 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NPTX2P47972 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NPTX2P47972 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NPTX2P47972 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NPTX2P47972 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NPTX2P47972 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NPTX2P47972 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NPTX2P47972 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NPTX2P47972 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NPTX2P47972 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NPTX2P47972 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NPTX2P47972 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NPTX2P47972 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NPTX2P47972 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NPTX2P47972 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NPTX2P47972 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NPTX2P47972 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NPTX2P47972 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NPTX2P47972 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NPTX2P47972 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NPTX2P47972 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NPTX2P47972 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NPTX2P47972 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NPTX2P47972 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NPTX2P47972 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NPTX2P47972 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NPTX2P47972 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NPTX2P47972 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NPTX2P47972 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NPTX2P47972 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NPTX2P47972 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NPTX2P47972 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPTX2P47972 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPTX2P47972 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPTX2P47972 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPTX2P47972 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NPTX2P47972 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NPTX2P47972 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NPTX2P47972 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NPTX2P47972 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NPTX2P47972 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NPTX2P47972 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NPTX2P47972 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NPTX2P47972 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NPTX2P47972 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NPTX2P47972 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NPTX2P47972 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NPTX2P47972 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NPTX2P47972 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NPTX2P47972 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NPTX2P47972 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NPTX2P47972 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NPTX2P47972 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NPTX2P47972 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NPTX2P47972 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NPTX2P47972 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NPTX2P47972 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NPTX2P47972 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NPTX2P47972 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NPTX2P47972 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NPTX2P47972 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NPTX2P47972 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NPTX2P47972 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NPTX2P47972 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NPTX2P47972 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NPTX2P47972 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NPTX2P47972 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NPTX2P47972 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NPTX2P47972 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NPTX2P47972 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NPTX2P47972 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NPTX2P47972 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NPTX2P47972 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NPTX2P47972 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NPTX2P47972 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NPTX2P47972 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NPTX2P47972 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NPTX2P47972 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NPTX2P47972 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NPTX2P47972 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NPTX2P47972 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NPTX2P47972 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NPTX2P47972 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms