Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNT3P45378 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNT3P45378 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TNNT3P45378 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNNT3P45378 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TNNT3P45378 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TNNT3P45378 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TNNT3P45378 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNNT3P45378 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNNT3P45378 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNNT3P45378 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNNT3P45378 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNNT3P45378 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNT3P45378 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNT3P45378 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNNT3P45378 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNT3P45378 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNT3P45378 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNT3P45378 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNT3P45378 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNT3P45378 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNT3P45378 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNNT3P45378 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNT3P45378 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNT3P45378 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNT3P45378 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNT3P45378 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNT3P45378 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNNT3P45378 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNT3P45378 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNT3P45378 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNT3P45378 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNNT3P45378 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNNT3P45378 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNNT3P45378 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNNT3P45378 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNNT3P45378 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNT3P45378 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNNT3P45378 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNT3P45378 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNT3P45378 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNNT3P45378 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNT3P45378 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNT3P45378 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNT3P45378 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNT3P45378 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNT3P45378 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNNT3P45378 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNT3P45378 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNNT3P45378 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNT3P45378 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNT3P45378 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNT3P45378 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNT3P45378 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNNT3P45378 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNT3P45378 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNT3P45378 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNT3P45378 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNT3P45378 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNT3P45378 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNT3P45378 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNT3P45378 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNNT3P45378 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNT3P45378 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNT3P45378 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNT3P45378 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNT3P45378 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNT3P45378 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNT3P45378 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNT3P45378 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNT3P45378 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNNT3P45378 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNT3P45378 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNT3P45378 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNT3P45378 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNNT3P45378 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNT3P45378 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNT3P45378 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNT3P45378 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNT3P45378 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNT3P45378 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNNT3P45378 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNT3P45378 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNT3P45378 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNT3P45378 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNT3P45378 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNNT3P45378 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNT3P45378 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNT3P45378 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNT3P45378 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNT3P45378 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TNNT3P45378 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNT3P45378 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNT3P45378 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNT3P45378 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNT3P45378 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNT3P45378 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNNT3P45378 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNT3P45378 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNNT3P45378 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms