Protein–RNA interactions for Protein: P43003

SLC1A3, Excitatory amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A3P43003 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC1A3P43003 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A3P43003 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A3P43003 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A3P43003 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A3P43003 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A3P43003 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A3P43003 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A3P43003 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A3P43003 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A3P43003 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A3P43003 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A3P43003 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A3P43003 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A3P43003 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A3P43003 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A3P43003 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A3P43003 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A3P43003 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A3P43003 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A3P43003 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A3P43003 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A3P43003 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A3P43003 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A3P43003 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A3P43003 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A3P43003 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A3P43003 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A3P43003 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A3P43003 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A3P43003 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A3P43003 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A3P43003 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A3P43003 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A3P43003 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC1A3P43003 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC1A3P43003 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A3P43003 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A3P43003 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A3P43003 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A3P43003 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A3P43003 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC1A3P43003 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A3P43003 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A3P43003 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A3P43003 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A3P43003 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A3P43003 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A3P43003 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A3P43003 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A3P43003 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A3P43003 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A3P43003 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A3P43003 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A3P43003 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A3P43003 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A3P43003 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A3P43003 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A3P43003 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A3P43003 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A3P43003 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A3P43003 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A3P43003 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A3P43003 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A3P43003 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A3P43003 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC1A3P43003 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC1A3P43003 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC1A3P43003 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC1A3P43003 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC1A3P43003 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A3P43003 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A3P43003 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A3P43003 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A3P43003 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A3P43003 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A3P43003 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A3P43003 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A3P43003 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A3P43003 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A3P43003 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A3P43003 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A3P43003 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A3P43003 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A3P43003 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A3P43003 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A3P43003 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A3P43003 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A3P43003 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A3P43003 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A3P43003 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A3P43003 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A3P43003 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A3P43003 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A3P43003 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A3P43003 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A3P43003 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A3P43003 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC1A3P43003 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC1A3P43003 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms