Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MTHFRP42898 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTHFRP42898 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTHFRP42898 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
MTHFRP42898 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTHFRP42898 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MTHFRP42898 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MTHFRP42898 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MTHFRP42898 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTHFRP42898 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTHFRP42898 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTHFRP42898 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
MTHFRP42898 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTHFRP42898 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTHFRP42898 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
MTHFRP42898 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTHFRP42898 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTHFRP42898 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MTHFRP42898 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MTHFRP42898 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTHFRP42898 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTHFRP42898 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTHFRP42898 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTHFRP42898 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTHFRP42898 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTHFRP42898 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTHFRP42898 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTHFRP42898 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTHFRP42898 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTHFRP42898 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTHFRP42898 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MTHFRP42898 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
MTHFRP42898 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MTHFRP42898 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MTHFRP42898 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MTHFRP42898 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MTHFRP42898 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MTHFRP42898 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MTHFRP42898 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MTHFRP42898 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MTHFRP42898 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MTHFRP42898 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MTHFRP42898 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTHFRP42898 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTHFRP42898 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTHFRP42898 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTHFRP42898 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MTHFRP42898 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MTHFRP42898 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
MTHFRP42898 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MTHFRP42898 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MTHFRP42898 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MTHFRP42898 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MTHFRP42898 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MTHFRP42898 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MTHFRP42898 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MTHFRP42898 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MTHFRP42898 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MTHFRP42898 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MTHFRP42898 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MTHFRP42898 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MTHFRP42898 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MTHFRP42898 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MTHFRP42898 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MTHFRP42898 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MTHFRP42898 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MTHFRP42898 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MTHFRP42898 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MTHFRP42898 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MTHFRP42898 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MTHFRP42898 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MTHFRP42898 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MTHFRP42898 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MTHFRP42898 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MTHFRP42898 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MTHFRP42898 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MTHFRP42898 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MTHFRP42898 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MTHFRP42898 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MTHFRP42898 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MTHFRP42898 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MTHFRP42898 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MTHFRP42898 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MTHFRP42898 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MTHFRP42898 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MTHFRP42898 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MTHFRP42898 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MTHFRP42898 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MTHFRP42898 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MTHFRP42898 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MTHFRP42898 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MTHFRP42898 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MTHFRP42898 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MTHFRP42898 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MTHFRP42898 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MTHFRP42898 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MTHFRP42898 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MTHFRP42898 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MTHFRP42898 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MTHFRP42898 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms