Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP3P42574 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP3P42574 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP3P42574 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP3P42574 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP3P42574 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP3P42574 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP3P42574 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP3P42574 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP3P42574 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP3P42574 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP3P42574 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP3P42574 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP3P42574 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP3P42574 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP3P42574 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP3P42574 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP3P42574 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP3P42574 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP3P42574 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP3P42574 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP3P42574 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP3P42574 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP3P42574 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP3P42574 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP3P42574 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP3P42574 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP3P42574 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP3P42574 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP3P42574 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP3P42574 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP3P42574 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP3P42574 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP3P42574 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP3P42574 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP3P42574 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP3P42574 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP3P42574 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP3P42574 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP3P42574 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP3P42574 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP3P42574 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP3P42574 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP3P42574 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP3P42574 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP3P42574 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP3P42574 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP3P42574 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP3P42574 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP3P42574 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP3P42574 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP3P42574 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP3P42574 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP3P42574 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP3P42574 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP3P42574 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP3P42574 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP3P42574 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP3P42574 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP3P42574 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP3P42574 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP3P42574 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP3P42574 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP3P42574 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP3P42574 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP3P42574 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP3P42574 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASP3P42574 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CASP3P42574 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CASP3P42574 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP3P42574 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP3P42574 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP3P42574 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP3P42574 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP3P42574 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP3P42574 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP3P42574 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP3P42574 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP3P42574 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP3P42574 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP3P42574 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP3P42574 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP3P42574 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP3P42574 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP3P42574 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP3P42574 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP3P42574 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP3P42574 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP3P42574 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP3P42574 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP3P42574 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP3P42574 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP3P42574 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP3P42574 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP3P42574 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP3P42574 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP3P42574 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP3P42574 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP3P42574 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP3P42574 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms