Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGDSP41222 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGDSP41222 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGDSP41222 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGDSP41222 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGDSP41222 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGDSP41222 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGDSP41222 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGDSP41222 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGDSP41222 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGDSP41222 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGDSP41222 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGDSP41222 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGDSP41222 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGDSP41222 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGDSP41222 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGDSP41222 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGDSP41222 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGDSP41222 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGDSP41222 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGDSP41222 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGDSP41222 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGDSP41222 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGDSP41222 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGDSP41222 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGDSP41222 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGDSP41222 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGDSP41222 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGDSP41222 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGDSP41222 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGDSP41222 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGDSP41222 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGDSP41222 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGDSP41222 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGDSP41222 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGDSP41222 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGDSP41222 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGDSP41222 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGDSP41222 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGDSP41222 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGDSP41222 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGDSP41222 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGDSP41222 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGDSP41222 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGDSP41222 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGDSP41222 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGDSP41222 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGDSP41222 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGDSP41222 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGDSP41222 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGDSP41222 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGDSP41222 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGDSP41222 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGDSP41222 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGDSP41222 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGDSP41222 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGDSP41222 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGDSP41222 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGDSP41222 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGDSP41222 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGDSP41222 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGDSP41222 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGDSP41222 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGDSP41222 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTGDSP41222 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTGDSP41222 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTGDSP41222 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGDSP41222 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGDSP41222 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGDSP41222 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGDSP41222 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGDSP41222 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGDSP41222 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGDSP41222 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGDSP41222 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGDSP41222 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGDSP41222 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGDSP41222 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGDSP41222 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGDSP41222 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGDSP41222 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGDSP41222 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGDSP41222 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGDSP41222 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGDSP41222 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGDSP41222 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGDSP41222 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGDSP41222 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGDSP41222 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGDSP41222 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGDSP41222 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGDSP41222 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGDSP41222 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGDSP41222 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGDSP41222 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGDSP41222 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGDSP41222 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGDSP41222 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGDSP41222 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTGDSP41222 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms