Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 GUT1YHL032C 2130 nt7.14□□□□□ -1.27
DDI1P40087 THI73YLR004C 1572 nt7.14□□□□□ -1.27
DDI1P40087 LEO1YOR123C 1395 nt7.14□□□□□ -1.27
DDI1P40087 PPS1YBR276C 2424 nt7.14□□□□□ -1.27
DDI1P40087 RCF2YNR018W 675 nt7.13□□□□□ -1.27
DDI1P40087 PRB1YEL060C 1908 nt7.13□□□□□ -1.27
DDI1P40087 BAP3YDR046C 1815 nt7.13□□□□□ -1.27
DDI1P40087 ICL2YPR006C 1728 nt7.13□□□□□ -1.27
DDI1P40087 YKR018CYKR018C 2178 nt7.12□□□□□ -1.27
DDI1P40087 YCR061WYCR061W 1896 nt7.11□□□□□ -1.27
DDI1P40087 DCR2YLR361C 1737 nt7.11□□□□□ -1.27
DDI1P40087 PUP3YER094C 618 nt7.11□□□□□ -1.27
DDI1P40087 Q0010Q0010 387 nt7.11□□□□□ -1.27
DDI1P40087 PDC6YGR087C 1692 nt7.11□□□□□ -1.27
DDI1P40087 CMK2YOL016C 1344 nt7.1□□□□□ -1.27
DDI1P40087 GTS1YGL181W 1191 nt7.1□□□□□ -1.27
DDI1P40087 HXT8YJL214W 1710 nt7.1□□□□□ -1.27
DDI1P40087 YBL113CYBL113C 2379 nt7.09□□□□□ -1.27
DDI1P40087 TRR1YDR353W 960 nt7.09□□□□□ -1.27
DDI1P40087 SNA3YJL151C 402 nt7.09□□□□□ -1.27
DDI1P40087 HAM1YJR069C 594 nt7.09□□□□□ -1.27
DDI1P40087 MNN9YPL050C 1188 nt7.09□□□□□ -1.27
DDI1P40087 AOS1YPR180W 1044 nt7.09□□□□□ -1.27
DDI1P40087 YOR389WYOR389W 1875 nt7.09□□□□□ -1.28
DDI1P40087 STF1YDL130W-A 261 nt7.08□□□□□ -1.28
DDI1P40087 PAU5YFL020C 369 nt7.08□□□□□ -1.28
DDI1P40087 CDD1YLR245C 429 nt7.08□□□□□ -1.28
DDI1P40087 YLR280CYLR280C 351 nt7.08□□□□□ -1.28
DDI1P40087 CDC23YHR166C 1881 nt7.08□□□□□ -1.28
DDI1P40087 IGD1YFR017C 588 nt7.07□□□□□ -1.28
DDI1P40087 RMD8YFR048W 1989 nt7.07□□□□□ -1.28
DDI1P40087 SSC1YJR045C 1965 nt7.07□□□□□ -1.28
DDI1P40087 ACO1YLR304C 2337 nt7.07□□□□□ -1.28
DDI1P40087 OCH1YGL038C 1443 nt7.07□□□□□ -1.28
DDI1P40087 TOD6YBL054W 1578 nt7.07□□□□□ -1.28
DDI1P40087 SHC1YER096W 1539 nt7.06□□□□□ -1.28
DDI1P40087 CAN1YEL063C 1773 nt7.05□□□□□ -1.28
DDI1P40087 YPT31YER031C 672 nt7.05□□□□□ -1.28
DDI1P40087 HRA1HRA1 564 nt7.05□□□□□ -1.28
DDI1P40087 PET10YKR046C 852 nt7.05□□□□□ -1.28
DDI1P40087 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt7.05□□□□□ -1.28
DDI1P40087 TPI1YDR050C 747 nt7.04□□□□□ -1.28
DDI1P40087 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt7.04□□□□□ -1.28
DDI1P40087 SEC24YIL109C 2781 nt7.04□□□□□ -1.28
DDI1P40087 CKI1YLR133W 1749 nt7.04□□□□□ -1.28
DDI1P40087 HEL1YKR017C 1656 nt7.03□□□□□ -1.28
DDI1P40087 CYC3YAL039C 810 nt7.03□□□□□ -1.28
DDI1P40087 SNF7YLR025W 723 nt7.03□□□□□ -1.28
DDI1P40087 PRE10YOR362C 867 nt7.03□□□□□ -1.28
DDI1P40087 RTC2YBR147W 891 nt7.03□□□□□ -1.28
DDI1P40087 YJL043WYJL043W 774 nt7.02□□□□□ -1.29
DDI1P40087 SRP102YKL154W 735 nt7.02□□□□□ -1.29
DDI1P40087 SEN2YLR105C 1134 nt7.02□□□□□ -1.29
DDI1P40087 RFS1YBR052C 633 nt7.02□□□□□ -1.29
DDI1P40087 VTS1YOR359W 1572 nt7.02□□□□□ -1.29
DDI1P40087 AGP2YBR132C 1791 nt7.02□□□□□ -1.29
DDI1P40087 CAK1YFL029C 1107 nt7.01□□□□□ -1.29
DDI1P40087 YHR033WYHR033W 1272 nt7.01□□□□□ -1.29
DDI1P40087 DST1YGL043W 930 nt7□□□□□ -1.29
DDI1P40087 NAP1YKR048C 1254 nt7□□□□□ -1.29
DDI1P40087 STP3YLR375W 1032 nt7□□□□□ -1.29
DDI1P40087 TCB1YOR086C 3561 nt7□□□□□ -1.29
DDI1P40087 HNM1YGL077C 1692 nt7□□□□□ -1.29
DDI1P40087 FLX1YIL134W 936 nt6.99□□□□□ -1.29
DDI1P40087 ARG7YMR062C 1326 nt6.99□□□□□ -1.29
DDI1P40087 ERO1YML130C 1692 nt6.98□□□□□ -1.29
DDI1P40087 PRY2YKR013W 990 nt6.98□□□□□ -1.29
DDI1P40087 YMR166CYMR166C 1107 nt6.98□□□□□ -1.29
DDI1P40087 TOS2YGR221C 1869 nt6.98□□□□□ -1.29
DDI1P40087 MSS51YLR203C 1311 nt6.98□□□□□ -1.29
DDI1P40087 FLC2YAL053W 2352 nt6.97□□□□□ -1.29
DDI1P40087 VPS65YLR322W 315 nt6.97□□□□□ -1.29
DDI1P40087 CAR2YLR438W 1275 nt6.97□□□□□ -1.29
DDI1P40087 TIM50YPL063W 1431 nt6.96□□□□□ -1.3
DDI1P40087 YDR327WYDR327W 327 nt6.96□□□□□ -1.3
DDI1P40087 PPZ2YDR436W 2133 nt6.96□□□□□ -1.3
DDI1P40087 PGC1YPL206C 966 nt6.96□□□□□ -1.3
DDI1P40087 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt6.95□□□□□ -1.3
DDI1P40087 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt6.95□□□□□ -1.3
DDI1P40087 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt6.95□□□□□ -1.3
DDI1P40087 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt6.95□□□□□ -1.3
DDI1P40087 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt6.95□□□□□ -1.3
DDI1P40087 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt6.95□□□□□ -1.3
DDI1P40087 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt6.95□□□□□ -1.3
DDI1P40087 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt6.95□□□□□ -1.3
DDI1P40087 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt6.95□□□□□ -1.3
DDI1P40087 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt6.95□□□□□ -1.3
DDI1P40087 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt6.95□□□□□ -1.3
DDI1P40087 YJR154WYJR154W 1041 nt6.95□□□□□ -1.3
DDI1P40087 HSM3YBR272C 1443 nt6.94□□□□□ -1.3
DDI1P40087 ERV25YML012W 636 nt6.94□□□□□ -1.3
DDI1P40087 SNF4YGL115W 969 nt6.93□□□□□ -1.3
DDI1P40087 RRT14YIL127C 621 nt6.93□□□□□ -1.3
DDI1P40087 AIM2YAL049C 741 nt6.93□□□□□ -1.3
DDI1P40087 IPL1YPL209C 1104 nt6.93□□□□□ -1.3
DDI1P40087 YAH1YPL252C 519 nt6.93□□□□□ -1.3
DDI1P40087 YPC1YBR183W 951 nt6.93□□□□□ -1.3
DDI1P40087 MEU1YLR017W 1014 nt6.92□□□□□ -1.3
DDI1P40087 LSP1YPL004C 1026 nt6.92□□□□□ -1.3
DDI1P40087 SRF1YDL133W 1314 nt6.92□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 59.9 ms