Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX11P35716 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX11P35716 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOX11P35716 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOX11P35716 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOX11P35716 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOX11P35716 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOX11P35716 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOX11P35716 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOX11P35716 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOX11P35716 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOX11P35716 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOX11P35716 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX11P35716 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX11P35716 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX11P35716 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX11P35716 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX11P35716 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX11P35716 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX11P35716 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX11P35716 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX11P35716 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX11P35716 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX11P35716 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX11P35716 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX11P35716 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX11P35716 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX11P35716 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SOX11P35716 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX11P35716 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX11P35716 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX11P35716 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX11P35716 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOX11P35716 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX11P35716 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOX11P35716 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX11P35716 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX11P35716 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX11P35716 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX11P35716 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOX11P35716 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOX11P35716 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOX11P35716 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX11P35716 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX11P35716 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOX11P35716 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SOX11P35716 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SOX11P35716 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SOX11P35716 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SOX11P35716 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX11P35716 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX11P35716 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX11P35716 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOX11P35716 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOX11P35716 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOX11P35716 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOX11P35716 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOX11P35716 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOX11P35716 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOX11P35716 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SOX11P35716 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SOX11P35716 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOX11P35716 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOX11P35716 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOX11P35716 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOX11P35716 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOX11P35716 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOX11P35716 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOX11P35716 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOX11P35716 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOX11P35716 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOX11P35716 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOX11P35716 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOX11P35716 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOX11P35716 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOX11P35716 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SOX11P35716 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SOX11P35716 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SOX11P35716 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOX11P35716 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOX11P35716 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SOX11P35716 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SOX11P35716 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SOX11P35716 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOX11P35716 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX11P35716 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX11P35716 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX11P35716 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX11P35716 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX11P35716 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX11P35716 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX11P35716 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX11P35716 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX11P35716 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOX11P35716 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX11P35716 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX11P35716 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX11P35716 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SOX11P35716 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX11P35716 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms