Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ACTN2P35609 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ACTN2P35609 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ACTN2P35609 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ACTN2P35609 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ACTN2P35609 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ACTN2P35609 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ACTN2P35609 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ACTN2P35609 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ACTN2P35609 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ACTN2P35609 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ACTN2P35609 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ACTN2P35609 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ACTN2P35609 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ACTN2P35609 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ACTN2P35609 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ACTN2P35609 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ACTN2P35609 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ACTN2P35609 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ACTN2P35609 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ACTN2P35609 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ACTN2P35609 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ACTN2P35609 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ACTN2P35609 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ACTN2P35609 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ACTN2P35609 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ACTN2P35609 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ACTN2P35609 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ACTN2P35609 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ACTN2P35609 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ACTN2P35609 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ACTN2P35609 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ACTN2P35609 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ACTN2P35609 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ACTN2P35609 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACTN2P35609 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACTN2P35609 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACTN2P35609 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACTN2P35609 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACTN2P35609 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ACTN2P35609 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ACTN2P35609 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ACTN2P35609 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ACTN2P35609 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ACTN2P35609 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ACTN2P35609 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ACTN2P35609 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ACTN2P35609 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ACTN2P35609 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ACTN2P35609 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ACTN2P35609 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ACTN2P35609 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ACTN2P35609 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ACTN2P35609 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ACTN2P35609 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ACTN2P35609 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ACTN2P35609 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ACTN2P35609 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACTN2P35609 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACTN2P35609 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACTN2P35609 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACTN2P35609 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ACTN2P35609 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACTN2P35609 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACTN2P35609 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACTN2P35609 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACTN2P35609 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACTN2P35609 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACTN2P35609 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ACTN2P35609 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ACTN2P35609 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ACTN2P35609 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ACTN2P35609 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
ACTN2P35609 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
ACTN2P35609 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACTN2P35609 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACTN2P35609 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACTN2P35609 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACTN2P35609 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACTN2P35609 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ACTN2P35609 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACTN2P35609 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ACTN2P35609 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACTN2P35609 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACTN2P35609 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACTN2P35609 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACTN2P35609 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACTN2P35609 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACTN2P35609 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACTN2P35609 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACTN2P35609 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ACTN2P35609 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACTN2P35609 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACTN2P35609 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACTN2P35609 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACTN2P35609 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACTN2P35609 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACTN2P35609 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACTN2P35609 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACTN2P35609 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms