Protein–RNA interactions for Protein: P35408

PTGER4, Prostaglandin E2 receptor EP4 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER4P35408 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGER4P35408 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGER4P35408 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGER4P35408 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGER4P35408 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGER4P35408 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGER4P35408 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGER4P35408 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGER4P35408 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGER4P35408 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGER4P35408 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGER4P35408 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGER4P35408 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGER4P35408 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGER4P35408 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGER4P35408 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGER4P35408 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGER4P35408 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGER4P35408 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGER4P35408 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGER4P35408 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGER4P35408 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGER4P35408 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGER4P35408 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTGER4P35408 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGER4P35408 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGER4P35408 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGER4P35408 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGER4P35408 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGER4P35408 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGER4P35408 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGER4P35408 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGER4P35408 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGER4P35408 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGER4P35408 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGER4P35408 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGER4P35408 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGER4P35408 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGER4P35408 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGER4P35408 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGER4P35408 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGER4P35408 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGER4P35408 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGER4P35408 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGER4P35408 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGER4P35408 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGER4P35408 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGER4P35408 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGER4P35408 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGER4P35408 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGER4P35408 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGER4P35408 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGER4P35408 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGER4P35408 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGER4P35408 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGER4P35408 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGER4P35408 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTGER4P35408 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTGER4P35408 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTGER4P35408 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGER4P35408 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGER4P35408 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGER4P35408 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTGER4P35408 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGER4P35408 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGER4P35408 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGER4P35408 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGER4P35408 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGER4P35408 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTGER4P35408 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGER4P35408 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGER4P35408 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGER4P35408 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGER4P35408 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGER4P35408 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGER4P35408 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGER4P35408 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGER4P35408 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER4P35408 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER4P35408 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER4P35408 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER4P35408 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER4P35408 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER4P35408 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER4P35408 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER4P35408 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER4P35408 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER4P35408 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGER4P35408 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGER4P35408 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGER4P35408 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGER4P35408 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGER4P35408 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGER4P35408 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGER4P35408 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGER4P35408 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGER4P35408 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGER4P35408 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGER4P35408 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGER4P35408 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms