Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCVRNP35243 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCVRNP35243 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCVRNP35243 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCVRNP35243 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCVRNP35243 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCVRNP35243 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCVRNP35243 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCVRNP35243 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCVRNP35243 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCVRNP35243 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCVRNP35243 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCVRNP35243 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RCVRNP35243 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RCVRNP35243 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCVRNP35243 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCVRNP35243 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCVRNP35243 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCVRNP35243 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCVRNP35243 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RCVRNP35243 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCVRNP35243 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCVRNP35243 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RCVRNP35243 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCVRNP35243 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCVRNP35243 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCVRNP35243 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCVRNP35243 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCVRNP35243 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCVRNP35243 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCVRNP35243 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RCVRNP35243 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RCVRNP35243 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCVRNP35243 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCVRNP35243 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCVRNP35243 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCVRNP35243 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCVRNP35243 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCVRNP35243 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCVRNP35243 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCVRNP35243 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCVRNP35243 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCVRNP35243 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCVRNP35243 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCVRNP35243 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCVRNP35243 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RCVRNP35243 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCVRNP35243 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCVRNP35243 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCVRNP35243 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCVRNP35243 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCVRNP35243 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCVRNP35243 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCVRNP35243 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCVRNP35243 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCVRNP35243 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCVRNP35243 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCVRNP35243 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCVRNP35243 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCVRNP35243 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCVRNP35243 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCVRNP35243 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCVRNP35243 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCVRNP35243 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCVRNP35243 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCVRNP35243 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCVRNP35243 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCVRNP35243 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCVRNP35243 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCVRNP35243 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCVRNP35243 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCVRNP35243 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCVRNP35243 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCVRNP35243 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCVRNP35243 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCVRNP35243 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCVRNP35243 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCVRNP35243 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCVRNP35243 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCVRNP35243 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCVRNP35243 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCVRNP35243 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCVRNP35243 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCVRNP35243 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCVRNP35243 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCVRNP35243 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCVRNP35243 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCVRNP35243 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RCVRNP35243 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCVRNP35243 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCVRNP35243 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCVRNP35243 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCVRNP35243 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RCVRNP35243 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RCVRNP35243 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RCVRNP35243 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RCVRNP35243 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RCVRNP35243 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RCVRNP35243 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RCVRNP35243 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129 ms