Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MARCKSP29966 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MARCKSP29966 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MARCKSP29966 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MARCKSP29966 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MARCKSP29966 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MARCKSP29966 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MARCKSP29966 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MARCKSP29966 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MARCKSP29966 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MARCKSP29966 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MARCKSP29966 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
MARCKSP29966 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MARCKSP29966 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MARCKSP29966 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MARCKSP29966 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MARCKSP29966 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MARCKSP29966 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
MARCKSP29966 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
MARCKSP29966 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MARCKSP29966 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MARCKSP29966 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MARCKSP29966 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MARCKSP29966 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MARCKSP29966 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MARCKSP29966 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MARCKSP29966 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MARCKSP29966 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MARCKSP29966 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MARCKSP29966 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MARCKSP29966 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MARCKSP29966 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MARCKSP29966 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
MARCKSP29966 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
MARCKSP29966 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MARCKSP29966 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MARCKSP29966 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MARCKSP29966 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MARCKSP29966 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MARCKSP29966 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MARCKSP29966 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MARCKSP29966 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MARCKSP29966 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MARCKSP29966 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MARCKSP29966 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MARCKSP29966 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MARCKSP29966 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MARCKSP29966 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MARCKSP29966 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MARCKSP29966 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MARCKSP29966 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MARCKSP29966 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MARCKSP29966 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MARCKSP29966 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MARCKSP29966 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MARCKSP29966 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MARCKSP29966 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MARCKSP29966 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MARCKSP29966 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MARCKSP29966 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MARCKSP29966 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MARCKSP29966 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MARCKSP29966 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MARCKSP29966 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MARCKSP29966 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MARCKSP29966 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MARCKSP29966 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MARCKSP29966 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MARCKSP29966 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MARCKSP29966 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MARCKSP29966 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MARCKSP29966 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MARCKSP29966 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MARCKSP29966 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
MARCKSP29966 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MARCKSP29966 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MARCKSP29966 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MARCKSP29966 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MARCKSP29966 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MARCKSP29966 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MARCKSP29966 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MARCKSP29966 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MARCKSP29966 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MARCKSP29966 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MARCKSP29966 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MARCKSP29966 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MARCKSP29966 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MARCKSP29966 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MARCKSP29966 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MARCKSP29966 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MARCKSP29966 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MARCKSP29966 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MARCKSP29966 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MARCKSP29966 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MARCKSP29966 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MARCKSP29966 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MARCKSP29966 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MARCKSP29966 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MARCKSP29966 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MARCKSP29966 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms