Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNTFRP26992 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNTFRP26992 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNTFRP26992 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNTFRP26992 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNTFRP26992 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTFRP26992 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTFRP26992 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTFRP26992 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTFRP26992 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTFRP26992 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNTFRP26992 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNTFRP26992 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNTFRP26992 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNTFRP26992 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNTFRP26992 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNTFRP26992 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CNTFRP26992 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CNTFRP26992 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNTFRP26992 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNTFRP26992 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNTFRP26992 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CNTFRP26992 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNTFRP26992 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNTFRP26992 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNTFRP26992 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CNTFRP26992 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTFRP26992 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTFRP26992 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNTFRP26992 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTFRP26992 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTFRP26992 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTFRP26992 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNTFRP26992 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTFRP26992 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTFRP26992 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTFRP26992 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTFRP26992 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTFRP26992 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTFRP26992 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTFRP26992 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTFRP26992 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNTFRP26992 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTFRP26992 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNTFRP26992 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNTFRP26992 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTFRP26992 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTFRP26992 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTFRP26992 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTFRP26992 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTFRP26992 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTFRP26992 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTFRP26992 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNTFRP26992 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNTFRP26992 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNTFRP26992 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNTFRP26992 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNTFRP26992 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNTFRP26992 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNTFRP26992 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CNTFRP26992 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CNTFRP26992 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNTFRP26992 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNTFRP26992 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNTFRP26992 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNTFRP26992 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNTFRP26992 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNTFRP26992 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNTFRP26992 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNTFRP26992 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNTFRP26992 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNTFRP26992 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNTFRP26992 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNTFRP26992 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CNTFRP26992 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNTFRP26992 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CNTFRP26992 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNTFRP26992 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CNTFRP26992 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CNTFRP26992 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CNTFRP26992 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CNTFRP26992 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CNTFRP26992 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNTFRP26992 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNTFRP26992 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNTFRP26992 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNTFRP26992 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CNTFRP26992 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNTFRP26992 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNTFRP26992 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNTFRP26992 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNTFRP26992 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNTFRP26992 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CNTFRP26992 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNTFRP26992 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNTFRP26992 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNTFRP26992 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNTFRP26992 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNTFRP26992 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CNTFRP26992 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms