Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VARSP26640 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VARSP26640 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VARSP26640 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VARSP26640 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VARSP26640 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VARSP26640 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VARSP26640 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VARSP26640 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
VARSP26640 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VARSP26640 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VARSP26640 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VARSP26640 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
VARSP26640 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
VARSP26640 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VARSP26640 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VARSP26640 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VARSP26640 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
VARSP26640 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VARSP26640 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VARSP26640 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VARSP26640 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VARSP26640 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VARSP26640 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VARSP26640 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VARSP26640 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VARSP26640 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VARSP26640 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VARSP26640 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VARSP26640 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VARSP26640 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
VARSP26640 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VARSP26640 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VARSP26640 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VARSP26640 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VARSP26640 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VARSP26640 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VARSP26640 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VARSP26640 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VARSP26640 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VARSP26640 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VARSP26640 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VARSP26640 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VARSP26640 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VARSP26640 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VARSP26640 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VARSP26640 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VARSP26640 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VARSP26640 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VARSP26640 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VARSP26640 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VARSP26640 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VARSP26640 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VARSP26640 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VARSP26640 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VARSP26640 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
VARSP26640 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VARSP26640 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VARSP26640 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VARSP26640 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VARSP26640 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VARSP26640 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VARSP26640 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VARSP26640 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VARSP26640 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VARSP26640 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VARSP26640 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VARSP26640 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VARSP26640 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VARSP26640 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VARSP26640 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VARSP26640 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VARSP26640 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VARSP26640 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VARSP26640 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VARSP26640 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VARSP26640 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VARSP26640 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VARSP26640 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VARSP26640 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VARSP26640 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VARSP26640 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
VARSP26640 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VARSP26640 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VARSP26640 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VARSP26640 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VARSP26640 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
VARSP26640 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VARSP26640 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VARSP26640 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VARSP26640 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VARSP26640 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VARSP26640 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VARSP26640 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VARSP26640 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VARSP26640 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VARSP26640 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VARSP26640 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VARSP26640 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VARSP26640 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms