Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CHMLP26374 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CHMLP26374 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CHMLP26374 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CHMLP26374 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHMLP26374 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHMLP26374 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHMLP26374 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
CHMLP26374 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHMLP26374 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHMLP26374 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHMLP26374 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHMLP26374 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHMLP26374 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CHMLP26374 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CHMLP26374 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CHMLP26374 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CHMLP26374 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CHMLP26374 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CHMLP26374 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CHMLP26374 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CHMLP26374 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CHMLP26374 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CHMLP26374 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
CHMLP26374 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CHMLP26374 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CHMLP26374 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CHMLP26374 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CHMLP26374 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CHMLP26374 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CHMLP26374 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CHMLP26374 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CHMLP26374 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CHMLP26374 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CHMLP26374 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CHMLP26374 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CHMLP26374 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CHMLP26374 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CHMLP26374 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CHMLP26374 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CHMLP26374 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CHMLP26374 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CHMLP26374 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CHMLP26374 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CHMLP26374 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
CHMLP26374 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CHMLP26374 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CHMLP26374 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CHMLP26374 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CHMLP26374 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CHMLP26374 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CHMLP26374 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
CHMLP26374 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CHMLP26374 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CHMLP26374 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CHMLP26374 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CHMLP26374 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CHMLP26374 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CHMLP26374 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CHMLP26374 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CHMLP26374 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CHMLP26374 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CHMLP26374 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHMLP26374 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHMLP26374 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHMLP26374 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHMLP26374 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CHMLP26374 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CHMLP26374 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CHMLP26374 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CHMLP26374 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CHMLP26374 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
CHMLP26374 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CHMLP26374 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CHMLP26374 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CHMLP26374 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CHMLP26374 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CHMLP26374 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CHMLP26374 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
CHMLP26374 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHMLP26374 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHMLP26374 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHMLP26374 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHMLP26374 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CHMLP26374 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CHMLP26374 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CHMLP26374 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CHMLP26374 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CHMLP26374 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CHMLP26374 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CHMLP26374 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CHMLP26374 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHMLP26374 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHMLP26374 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHMLP26374 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHMLP26374 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHMLP26374 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHMLP26374 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHMLP26374 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.48
CHMLP26374 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms