Protein–RNA interactions for Protein: P24385

CCND1, G1/S-specific cyclin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND1P24385 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCND1P24385 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCND1P24385 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCND1P24385 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCND1P24385 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCND1P24385 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCND1P24385 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCND1P24385 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCND1P24385 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCND1P24385 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCND1P24385 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCND1P24385 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCND1P24385 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCND1P24385 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCND1P24385 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCND1P24385 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCND1P24385 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCND1P24385 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCND1P24385 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCND1P24385 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCND1P24385 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCND1P24385 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCND1P24385 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCND1P24385 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCND1P24385 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCND1P24385 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCND1P24385 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCND1P24385 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCND1P24385 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCND1P24385 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCND1P24385 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCND1P24385 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCND1P24385 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCND1P24385 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCND1P24385 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCND1P24385 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCND1P24385 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCND1P24385 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCND1P24385 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCND1P24385 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCND1P24385 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCND1P24385 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCND1P24385 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCND1P24385 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCND1P24385 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCND1P24385 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCND1P24385 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCND1P24385 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCND1P24385 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCND1P24385 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCND1P24385 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCND1P24385 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCND1P24385 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCND1P24385 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCND1P24385 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCND1P24385 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCND1P24385 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCND1P24385 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCND1P24385 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCND1P24385 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCND1P24385 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCND1P24385 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCND1P24385 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCND1P24385 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCND1P24385 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCND1P24385 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCND1P24385 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCND1P24385 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCND1P24385 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCND1P24385 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCND1P24385 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCND1P24385 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCND1P24385 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCND1P24385 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCND1P24385 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCND1P24385 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCND1P24385 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCND1P24385 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCND1P24385 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCND1P24385 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCND1P24385 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCND1P24385 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCND1P24385 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCND1P24385 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCND1P24385 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCND1P24385 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCND1P24385 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCND1P24385 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCND1P24385 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCND1P24385 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCND1P24385 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCND1P24385 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCND1P24385 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCND1P24385 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCND1P24385 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCND1P24385 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCND1P24385 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCND1P24385 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCND1P24385 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCND1P24385 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms