Protein–RNA interactions for Protein: P23458

JAK1, Tyrosine-protein kinase JAK1, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAK1P23458 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
JAK1P23458 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
JAK1P23458 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
JAK1P23458 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
JAK1P23458 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
JAK1P23458 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
JAK1P23458 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
JAK1P23458 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
JAK1P23458 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
JAK1P23458 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
JAK1P23458 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
JAK1P23458 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
JAK1P23458 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
JAK1P23458 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
JAK1P23458 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
JAK1P23458 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
JAK1P23458 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
JAK1P23458 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
JAK1P23458 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
JAK1P23458 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
JAK1P23458 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
JAK1P23458 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
JAK1P23458 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
JAK1P23458 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
JAK1P23458 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
JAK1P23458 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
JAK1P23458 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
JAK1P23458 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
JAK1P23458 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
JAK1P23458 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
JAK1P23458 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
JAK1P23458 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
JAK1P23458 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
JAK1P23458 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
JAK1P23458 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
JAK1P23458 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
JAK1P23458 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
JAK1P23458 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
JAK1P23458 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
JAK1P23458 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
JAK1P23458 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
JAK1P23458 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
JAK1P23458 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
JAK1P23458 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
JAK1P23458 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
JAK1P23458 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
JAK1P23458 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
JAK1P23458 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
JAK1P23458 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
JAK1P23458 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
JAK1P23458 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
JAK1P23458 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
JAK1P23458 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
JAK1P23458 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
JAK1P23458 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
JAK1P23458 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
JAK1P23458 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
JAK1P23458 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
JAK1P23458 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
JAK1P23458 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
JAK1P23458 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
JAK1P23458 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
JAK1P23458 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
JAK1P23458 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
JAK1P23458 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
JAK1P23458 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
JAK1P23458 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
JAK1P23458 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
JAK1P23458 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
JAK1P23458 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
JAK1P23458 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
JAK1P23458 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
JAK1P23458 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
JAK1P23458 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
JAK1P23458 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
JAK1P23458 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
JAK1P23458 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
JAK1P23458 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
JAK1P23458 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
JAK1P23458 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
JAK1P23458 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
JAK1P23458 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
JAK1P23458 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
JAK1P23458 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
JAK1P23458 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
JAK1P23458 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
JAK1P23458 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
JAK1P23458 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
JAK1P23458 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
JAK1P23458 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
JAK1P23458 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
JAK1P23458 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
JAK1P23458 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
JAK1P23458 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
JAK1P23458 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
JAK1P23458 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
JAK1P23458 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
JAK1P23458 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
JAK1P23458 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
JAK1P23458 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms