Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
HRCP23327 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
HRCP23327 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
HRCP23327 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
HRCP23327 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
HRCP23327 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC39.28■■■■□ 3.88
HRCP23327 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
HRCP23327 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
HRCP23327 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
HRCP23327 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
HRCP23327 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
HRCP23327 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC39.26■■■■□ 3.88
HRCP23327 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
HRCP23327 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
HRCP23327 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
HRCP23327 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
HRCP23327 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
HRCP23327 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
HRCP23327 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
HRCP23327 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
HRCP23327 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
HRCP23327 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
HRCP23327 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
HRCP23327 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
HRCP23327 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
HRCP23327 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
HRCP23327 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
HRCP23327 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
HRCP23327 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
HRCP23327 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
HRCP23327 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
HRCP23327 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC39.19■■■■□ 3.86
HRCP23327 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
HRCP23327 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC39.19■■■■□ 3.86
HRCP23327 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
HRCP23327 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
HRCP23327 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
HRCP23327 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
HRCP23327 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
HRCP23327 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC39.17■■■■□ 3.86
HRCP23327 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
HRCP23327 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
HRCP23327 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
HRCP23327 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
HRCP23327 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC39.15■■■■□ 3.86
HRCP23327 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
HRCP23327 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
HRCP23327 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
HRCP23327 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
HRCP23327 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
HRCP23327 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
HRCP23327 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
HRCP23327 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
HRCP23327 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
HRCP23327 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
HRCP23327 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
HRCP23327 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
HRCP23327 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
HRCP23327 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
HRCP23327 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC39.07■■■■□ 3.85
HRCP23327 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
HRCP23327 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
HRCP23327 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
HRCP23327 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
HRCP23327 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
HRCP23327 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
HRCP23327 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC39.05■■■■□ 3.84
HRCP23327 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
HRCP23327 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
HRCP23327 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
HRCP23327 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
HRCP23327 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
HRCP23327 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
HRCP23327 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
HRCP23327 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
HRCP23327 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
HRCP23327 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.83
HRCP23327 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
HRCP23327 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
HRCP23327 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
HRCP23327 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
HRCP23327 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
HRCP23327 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
HRCP23327 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
HRCP23327 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
HRCP23327 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
HRCP23327 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
HRCP23327 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
HRCP23327 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
HRCP23327 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
HRCP23327 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
HRCP23327 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
HRCP23327 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
HRCP23327 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
HRCP23327 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
HRCP23327 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
HRCP23327 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
HRCP23327 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
HRCP23327 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
HRCP23327 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms