Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTGS1P23219 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTGS1P23219 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTGS1P23219 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTGS1P23219 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTGS1P23219 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTGS1P23219 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTGS1P23219 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTGS1P23219 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTGS1P23219 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTGS1P23219 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTGS1P23219 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTGS1P23219 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PTGS1P23219 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTGS1P23219 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTGS1P23219 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTGS1P23219 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTGS1P23219 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTGS1P23219 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTGS1P23219 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTGS1P23219 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTGS1P23219 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTGS1P23219 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTGS1P23219 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTGS1P23219 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTGS1P23219 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTGS1P23219 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTGS1P23219 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTGS1P23219 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTGS1P23219 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTGS1P23219 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTGS1P23219 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTGS1P23219 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTGS1P23219 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTGS1P23219 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTGS1P23219 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTGS1P23219 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTGS1P23219 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTGS1P23219 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTGS1P23219 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTGS1P23219 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTGS1P23219 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTGS1P23219 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTGS1P23219 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTGS1P23219 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTGS1P23219 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTGS1P23219 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTGS1P23219 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTGS1P23219 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTGS1P23219 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTGS1P23219 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTGS1P23219 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTGS1P23219 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTGS1P23219 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTGS1P23219 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTGS1P23219 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTGS1P23219 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTGS1P23219 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTGS1P23219 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTGS1P23219 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTGS1P23219 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PTGS1P23219 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTGS1P23219 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTGS1P23219 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTGS1P23219 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTGS1P23219 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PTGS1P23219 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTGS1P23219 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTGS1P23219 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTGS1P23219 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTGS1P23219 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTGS1P23219 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTGS1P23219 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTGS1P23219 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTGS1P23219 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTGS1P23219 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTGS1P23219 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTGS1P23219 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTGS1P23219 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTGS1P23219 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTGS1P23219 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTGS1P23219 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PTGS1P23219 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTGS1P23219 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTGS1P23219 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTGS1P23219 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTGS1P23219 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTGS1P23219 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTGS1P23219 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTGS1P23219 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTGS1P23219 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTGS1P23219 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTGS1P23219 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTGS1P23219 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PTGS1P23219 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTGS1P23219 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTGS1P23219 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTGS1P23219 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PTGS1P23219 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTGS1P23219 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112 ms