Protein–RNA interactions for Protein: P23109

AMPD1, AMP deaminase 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD1P23109 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
AMPD1P23109 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
AMPD1P23109 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
AMPD1P23109 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
AMPD1P23109 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
AMPD1P23109 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AMPD1P23109 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AMPD1P23109 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
AMPD1P23109 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AMPD1P23109 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
AMPD1P23109 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
AMPD1P23109 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AMPD1P23109 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
AMPD1P23109 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
AMPD1P23109 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AMPD1P23109 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AMPD1P23109 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AMPD1P23109 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AMPD1P23109 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AMPD1P23109 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AMPD1P23109 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AMPD1P23109 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AMPD1P23109 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
AMPD1P23109 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AMPD1P23109 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
AMPD1P23109 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AMPD1P23109 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AMPD1P23109 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AMPD1P23109 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AMPD1P23109 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
AMPD1P23109 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AMPD1P23109 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
AMPD1P23109 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AMPD1P23109 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AMPD1P23109 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AMPD1P23109 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AMPD1P23109 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
AMPD1P23109 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
AMPD1P23109 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AMPD1P23109 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AMPD1P23109 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
AMPD1P23109 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
AMPD1P23109 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AMPD1P23109 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
AMPD1P23109 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AMPD1P23109 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
AMPD1P23109 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AMPD1P23109 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AMPD1P23109 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
AMPD1P23109 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
AMPD1P23109 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AMPD1P23109 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AMPD1P23109 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AMPD1P23109 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AMPD1P23109 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AMPD1P23109 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AMPD1P23109 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
AMPD1P23109 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
AMPD1P23109 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
AMPD1P23109 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AMPD1P23109 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
AMPD1P23109 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
AMPD1P23109 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AMPD1P23109 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
AMPD1P23109 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AMPD1P23109 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AMPD1P23109 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AMPD1P23109 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AMPD1P23109 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AMPD1P23109 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AMPD1P23109 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AMPD1P23109 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AMPD1P23109 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AMPD1P23109 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AMPD1P23109 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AMPD1P23109 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AMPD1P23109 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AMPD1P23109 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AMPD1P23109 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AMPD1P23109 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AMPD1P23109 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AMPD1P23109 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AMPD1P23109 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
AMPD1P23109 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
AMPD1P23109 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
AMPD1P23109 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AMPD1P23109 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AMPD1P23109 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AMPD1P23109 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AMPD1P23109 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AMPD1P23109 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AMPD1P23109 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AMPD1P23109 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AMPD1P23109 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AMPD1P23109 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
AMPD1P23109 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AMPD1P23109 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AMPD1P23109 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AMPD1P23109 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AMPD1P23109 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms