Protein–RNA interactions for Protein: P20674

COX5A, Cytochrome c oxidase subunit 5A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5AP20674 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COX5AP20674 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COX5AP20674 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COX5AP20674 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COX5AP20674 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COX5AP20674 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COX5AP20674 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COX5AP20674 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COX5AP20674 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
COX5AP20674 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COX5AP20674 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COX5AP20674 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COX5AP20674 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COX5AP20674 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COX5AP20674 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COX5AP20674 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COX5AP20674 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COX5AP20674 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COX5AP20674 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COX5AP20674 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COX5AP20674 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COX5AP20674 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COX5AP20674 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COX5AP20674 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COX5AP20674 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COX5AP20674 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COX5AP20674 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COX5AP20674 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COX5AP20674 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COX5AP20674 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COX5AP20674 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COX5AP20674 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COX5AP20674 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COX5AP20674 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COX5AP20674 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COX5AP20674 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COX5AP20674 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COX5AP20674 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COX5AP20674 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COX5AP20674 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COX5AP20674 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COX5AP20674 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COX5AP20674 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COX5AP20674 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COX5AP20674 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COX5AP20674 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COX5AP20674 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COX5AP20674 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COX5AP20674 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COX5AP20674 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COX5AP20674 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COX5AP20674 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COX5AP20674 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COX5AP20674 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COX5AP20674 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COX5AP20674 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
COX5AP20674 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
COX5AP20674 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COX5AP20674 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COX5AP20674 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COX5AP20674 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COX5AP20674 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COX5AP20674 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COX5AP20674 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COX5AP20674 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COX5AP20674 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX5AP20674 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX5AP20674 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX5AP20674 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX5AP20674 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COX5AP20674 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COX5AP20674 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COX5AP20674 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COX5AP20674 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COX5AP20674 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COX5AP20674 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COX5AP20674 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COX5AP20674 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COX5AP20674 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COX5AP20674 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COX5AP20674 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COX5AP20674 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COX5AP20674 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COX5AP20674 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COX5AP20674 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COX5AP20674 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COX5AP20674 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COX5AP20674 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COX5AP20674 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COX5AP20674 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COX5AP20674 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COX5AP20674 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COX5AP20674 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COX5AP20674 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COX5AP20674 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COX5AP20674 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COX5AP20674 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COX5AP20674 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COX5AP20674 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COX5AP20674 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms