Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMB1P20618 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMB1P20618 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMB1P20618 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMB1P20618 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMB1P20618 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMB1P20618 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMB1P20618 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMB1P20618 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMB1P20618 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMB1P20618 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMB1P20618 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMB1P20618 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMB1P20618 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMB1P20618 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMB1P20618 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMB1P20618 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMB1P20618 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMB1P20618 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMB1P20618 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMB1P20618 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMB1P20618 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMB1P20618 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PSMB1P20618 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMB1P20618 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMB1P20618 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMB1P20618 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMB1P20618 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMB1P20618 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMB1P20618 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMB1P20618 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMB1P20618 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMB1P20618 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMB1P20618 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMB1P20618 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMB1P20618 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMB1P20618 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMB1P20618 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMB1P20618 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMB1P20618 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMB1P20618 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMB1P20618 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMB1P20618 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMB1P20618 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMB1P20618 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMB1P20618 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMB1P20618 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSMB1P20618 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMB1P20618 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMB1P20618 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMB1P20618 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMB1P20618 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMB1P20618 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMB1P20618 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMB1P20618 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMB1P20618 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMB1P20618 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMB1P20618 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMB1P20618 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMB1P20618 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMB1P20618 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMB1P20618 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMB1P20618 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMB1P20618 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMB1P20618 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMB1P20618 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMB1P20618 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMB1P20618 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMB1P20618 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMB1P20618 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMB1P20618 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMB1P20618 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMB1P20618 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMB1P20618 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMB1P20618 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMB1P20618 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMB1P20618 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMB1P20618 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMB1P20618 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSMB1P20618 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSMB1P20618 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMB1P20618 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMB1P20618 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMB1P20618 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMB1P20618 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMB1P20618 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMB1P20618 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMB1P20618 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMB1P20618 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMB1P20618 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMB1P20618 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMB1P20618 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMB1P20618 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMB1P20618 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMB1P20618 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMB1P20618 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMB1P20618 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMB1P20618 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMB1P20618 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMB1P20618 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms