Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NFKB1P19838 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NFKB1P19838 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NFKB1P19838 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NFKB1P19838 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NFKB1P19838 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NFKB1P19838 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFKB1P19838 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFKB1P19838 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFKB1P19838 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFKB1P19838 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFKB1P19838 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFKB1P19838 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFKB1P19838 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFKB1P19838 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFKB1P19838 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFKB1P19838 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFKB1P19838 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFKB1P19838 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFKB1P19838 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFKB1P19838 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFKB1P19838 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFKB1P19838 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFKB1P19838 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFKB1P19838 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFKB1P19838 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
NFKB1P19838 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NFKB1P19838 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFKB1P19838 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFKB1P19838 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFKB1P19838 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFKB1P19838 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFKB1P19838 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFKB1P19838 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFKB1P19838 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NFKB1P19838 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFKB1P19838 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFKB1P19838 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFKB1P19838 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFKB1P19838 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFKB1P19838 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFKB1P19838 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFKB1P19838 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFKB1P19838 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFKB1P19838 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFKB1P19838 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFKB1P19838 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFKB1P19838 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFKB1P19838 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFKB1P19838 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFKB1P19838 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFKB1P19838 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFKB1P19838 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFKB1P19838 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFKB1P19838 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFKB1P19838 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFKB1P19838 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFKB1P19838 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NFKB1P19838 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFKB1P19838 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFKB1P19838 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFKB1P19838 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFKB1P19838 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFKB1P19838 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NFKB1P19838 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFKB1P19838 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFKB1P19838 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFKB1P19838 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFKB1P19838 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFKB1P19838 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFKB1P19838 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NFKB1P19838 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFKB1P19838 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFKB1P19838 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFKB1P19838 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFKB1P19838 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFKB1P19838 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NFKB1P19838 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFKB1P19838 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFKB1P19838 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFKB1P19838 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFKB1P19838 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFKB1P19838 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFKB1P19838 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFKB1P19838 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFKB1P19838 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFKB1P19838 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFKB1P19838 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFKB1P19838 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFKB1P19838 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFKB1P19838 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFKB1P19838 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFKB1P19838 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFKB1P19838 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFKB1P19838 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFKB1P19838 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFKB1P19838 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFKB1P19838 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFKB1P19838 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFKB1P19838 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms