Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GM2AP17900 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GM2AP17900 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GM2AP17900 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GM2AP17900 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GM2AP17900 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GM2AP17900 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GM2AP17900 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GM2AP17900 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GM2AP17900 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GM2AP17900 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GM2AP17900 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GM2AP17900 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GM2AP17900 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GM2AP17900 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GM2AP17900 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GM2AP17900 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GM2AP17900 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GM2AP17900 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GM2AP17900 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GM2AP17900 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GM2AP17900 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GM2AP17900 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GM2AP17900 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GM2AP17900 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GM2AP17900 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GM2AP17900 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GM2AP17900 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GM2AP17900 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GM2AP17900 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GM2AP17900 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GM2AP17900 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GM2AP17900 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GM2AP17900 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GM2AP17900 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GM2AP17900 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GM2AP17900 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GM2AP17900 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GM2AP17900 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GM2AP17900 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GM2AP17900 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GM2AP17900 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GM2AP17900 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GM2AP17900 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GM2AP17900 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GM2AP17900 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GM2AP17900 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GM2AP17900 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GM2AP17900 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GM2AP17900 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GM2AP17900 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GM2AP17900 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GM2AP17900 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GM2AP17900 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GM2AP17900 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GM2AP17900 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GM2AP17900 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GM2AP17900 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GM2AP17900 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GM2AP17900 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GM2AP17900 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GM2AP17900 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GM2AP17900 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GM2AP17900 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GM2AP17900 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GM2AP17900 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GM2AP17900 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GM2AP17900 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GM2AP17900 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GM2AP17900 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GM2AP17900 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GM2AP17900 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GM2AP17900 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GM2AP17900 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GM2AP17900 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GM2AP17900 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GM2AP17900 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GM2AP17900 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GM2AP17900 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GM2AP17900 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GM2AP17900 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GM2AP17900 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GM2AP17900 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GM2AP17900 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GM2AP17900 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GM2AP17900 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GM2AP17900 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GM2AP17900 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GM2AP17900 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GM2AP17900 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GM2AP17900 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GM2AP17900 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GM2AP17900 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GM2AP17900 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GM2AP17900 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GM2AP17900 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GM2AP17900 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GM2AP17900 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GM2AP17900 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GM2AP17900 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms