Protein–RNA interactions for Protein: P16104

H2AFX, Histone H2AX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFXP16104 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
H2AFXP16104 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
H2AFXP16104 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
H2AFXP16104 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
H2AFXP16104 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
H2AFXP16104 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
H2AFXP16104 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
H2AFXP16104 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
H2AFXP16104 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
H2AFXP16104 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
H2AFXP16104 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
H2AFXP16104 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
H2AFXP16104 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
H2AFXP16104 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
H2AFXP16104 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
H2AFXP16104 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
H2AFXP16104 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
H2AFXP16104 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
H2AFXP16104 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
H2AFXP16104 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
H2AFXP16104 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
H2AFXP16104 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
H2AFXP16104 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
H2AFXP16104 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
H2AFXP16104 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
H2AFXP16104 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
H2AFXP16104 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
H2AFXP16104 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
H2AFXP16104 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
H2AFXP16104 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
H2AFXP16104 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
H2AFXP16104 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
H2AFXP16104 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
H2AFXP16104 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
H2AFXP16104 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
H2AFXP16104 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
H2AFXP16104 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
H2AFXP16104 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
H2AFXP16104 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
H2AFXP16104 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
H2AFXP16104 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
H2AFXP16104 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
H2AFXP16104 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
H2AFXP16104 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
H2AFXP16104 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
H2AFXP16104 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
H2AFXP16104 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
H2AFXP16104 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
H2AFXP16104 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
H2AFXP16104 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
H2AFXP16104 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
H2AFXP16104 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
H2AFXP16104 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
H2AFXP16104 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
H2AFXP16104 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
H2AFXP16104 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
H2AFXP16104 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
H2AFXP16104 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
H2AFXP16104 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
H2AFXP16104 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
H2AFXP16104 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
H2AFXP16104 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
H2AFXP16104 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
H2AFXP16104 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
H2AFXP16104 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
H2AFXP16104 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
H2AFXP16104 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
H2AFXP16104 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
H2AFXP16104 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
H2AFXP16104 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
H2AFXP16104 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
H2AFXP16104 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
H2AFXP16104 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
H2AFXP16104 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
H2AFXP16104 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
H2AFXP16104 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
H2AFXP16104 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
H2AFXP16104 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
H2AFXP16104 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
H2AFXP16104 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
H2AFXP16104 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
H2AFXP16104 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
H2AFXP16104 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
H2AFXP16104 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
H2AFXP16104 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
H2AFXP16104 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
H2AFXP16104 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
H2AFXP16104 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
H2AFXP16104 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
H2AFXP16104 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
H2AFXP16104 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
H2AFXP16104 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
H2AFXP16104 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
H2AFXP16104 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
H2AFXP16104 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
H2AFXP16104 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
H2AFXP16104 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
H2AFXP16104 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
H2AFXP16104 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
H2AFXP16104 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms